| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 4,498,182 | Δ1,336 bp | IS2‑mediated | insC6–insD6 | insC6, insD6 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4498182–4499510 | 4499517 | 8–1336 | 149 [1] | [3] 152 | insC6–insD6 | insC6,insD6 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4498181 | 1 (0.010) | 148 (1.360) | 95/586 | 0.0 | 99.7% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4499518 = | 0 (0.000) | intergenic (+18/‑1742) | insD6/yjgZ | IS2 insertion element protein InsB/uncharacterized protein YjgZ | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACCTTGTGCTGATATGAATACGGATATTTTATACAGAATACTTTTCAGTACAAGCGACTGTATTACAGTCTGCCATATATGATTACCTGTGATCAGGAAGAATAAGTGGCTGAGGTTTCAAACTGTCTGCCGGTATATTCCTCTCTCCCTTAAAAACCATAACAGGTTAGTTATCTTCGTCTGTCAGCGGATTGAATGGCGGTATATTTTCAGTACAAATACCGGTCATCCACTGAAAAATACCTGCGAAATGACGGGCACTGATTTTTCTACTGACGGGCTGATGAGACGTTATGTCACTGGCGGT > NC_000913/4499224‑4499817 | ggtttatcagtccatttgaatatgcaaagattaataatccattaaaacagtaatcatcccgggcaaatgcccgggaattattctaggattattttctttgttaaaaaagacaaacggtattaactgatgtatttactatttaccgctccctgcaggggggattatcagaatccgcggttattcattatttatatacattcaataaaaaagtaacctcataaaaaatcctgtactcacagggtgatgcgggataactgacgtagggagtgctgcagggatttgatggtcccttgtGCTGat > 1:94912‑M2/295‑300 (MQ=255) 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gtcccttgtGCTGATATGAATACGGATATTTTATACAGAATACTTTTCAGTACAAGCGACTGTATTACAGTCTGCCATATATGATTACCTGTGATCAGGAAGAAGAAGTGGCTGAGGTTTCAAACTGTCTGCCGGTATATTCCTCTCTCCCTTAAAAACCATAACAGGTTAGTTATCTTCGTCTGTCAGCGGATTGAATGGCGGTATATTTTCAGTACAAATACCGGTCATCCACTTAAAAATACCTGCGAAATGACGGGCACTGATTTTTCTACTGACGGGCTGATGAGACGTTATGTc < 2:112718‑M2/291‑1 (MQ=255) cTTGTGCTGATATGAATATAGATATTTTATACAGAATACTTTTCAGTACAAGCGACTGTATTACAGTCTGCCATATATGATTACCTGTGATCAGGAAGAATAAGTGGCTGAGGTTTCAAACTGTCTGCCGGTATATTCCTCTCTCCCTTAAAAACCATAACAGGTTAGTTATCTTCGTCTGTCAGCGGATTGAATGGCGGTATATTTTCAGTACAAATACCGGTCATCCACTGAAAAATACCTGCGAAATGACGGGCACTGATTTTTCTACTGACGGGCTGATTAGACGTTATGTCACTg < 2:427097/300‑1 (MQ=255) cTTGTGCTGATATGAATACGGATATTTTATACAGAATACTTTTCAGTACAAGCGACTGTATTACAGTCTGCCATATATGATTACCTGTGATCAGGAAGAATAAGTGGCTGAGGTTTCAAACTGTCTGCCGGTATATTCCTATCTCCCTTAAAAACCATAACAGGTTAGTTATCTTCGTCTGTCAGCGGATTGAATGGCGGTATATTTTCAGTACAAATACCGGTCATCCACTGAAAAATACCTGCGAAATGACGGGCACTGATTTTTCTACTGACGGGCTGATGAGACGTTATGTCaatg > 2:25537/1‑297 (MQ=255) | GTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACCTTGTGCTGATATGAATACGGATATTTTATACAGAATACTTTTCAGTACAAGCGACTGTATTACAGTCTGCCATATATGATTACCTGTGATCAGGAAGAATAAGTGGCTGAGGTTTCAAACTGTCTGCCGGTATATTCCTCTCTCCCTTAAAAACCATAACAGGTTAGTTATCTTCGTCTGTCAGCGGATTGAATGGCGGTATATTTTCAGTACAAATACCGGTCATCCACTGAAAAATACCTGCGAAATGACGGGCACTGATTTTTCTACTGACGGGCTGATGAGACGTTATGTCACTGGCGGT > NC_000913/4499224‑4499817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |