Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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JC JC | NC_000913 | 4,620,749 | IS1 (+) +9 bp | coding (1147‑1155/1224 nt) | deoB → | phosphopentomutase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 35 (0.320) | 19/598 | 4.9 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 4620749 = | 0 (0.000) | coding (1147/1224 nt) | deoB | phosphopentomutase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GAAGCGGGTGATAACACCATCGTCTTCACCAACTTCGTTGACTTCGACTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCCGCGGGTCTGGAACTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACCGCTGACCACGGTTGCGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTATATGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCATCGTGAAACCTTCGCGGATATCGGCCAGACTCTGGCAAAATATTTTGGTACTTCTGATATGGAATATGGCAAAGCCATGTTCTGATGGATTTGGGCGGAGCGTTGACTCCGCCTTTGTTATGTCACAAAAAGGATAAAACAATGGCTACCCCACACATTAATGCAGAAATGGGCGATTTCGCTGACGTAGTTTTGATGCCAGGCGACCCGCTGCGTGCGAAGTATATTGCTGAAACTTTCCTTGAAGATGCCCGTGAAGTGAACAACGTTCGCGGTATGCTGGGCTTCACCGGTACTTACAAAGGCCGCAAAA > NC_000913/4620473‑4621054 | gATAACACCATCGTCTTCACCAACTTCGTTGAATTCGACTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGGCGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTATGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGGTCCGAACTGGACCGGTATTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:164931‑M2/300‑25 (MQ=255) aTAACACCATCGTCTTCACCAACTTCGTTGACTTCGACTCTTCCTGGGGCCACCTTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGCCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgattt > 2:841066‑M2/1‑275 (MQ=255) aTCGTCTTCACCAACTTCGTTGACTTCGACTCTTCCTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGTTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACCCATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAAACGGGCTCACTNGGTCACCGTGAAACCTTCGAGggtgatgctgccaacttcctgatttagtgtatg < 2:654798‑M2/300‑34 (MQ=255) cGTCTTCACCAACTTCGTTGACTTCGACTCTTCCTGGTGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATNCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:205019‑M2/1‑265 (MQ=255) 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cTGGGGCCACCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:240531‑M2/1‑232 (MQ=255) gCCACCTTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCTGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAAAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatc > 1:849455‑M2/1‑227 (MQ=255) aCCGTCGCGACGTCGCCGGTTATGCTGCGGGTCTGGAGCTGTTCGACCGCCGTCNGCCGGAGCTGATGTCTCTGCTGCGCGATGACGACATCCTGATCCTCACTGCTGACCACGGTTGTGATCCGACCTGGACCGGTACTGACCACACGCGTGAACACATTCCGGTACTGGTTTACGGCCCGAGAGTAAAACCGGGCTCACTGGGTCACCGTGAAACCTTCGCGggtgatgctgccaacttacngatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagc > 2:805018‑M2/1‑224 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |