| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 20,703 | +GCAAGAACCTGCAA | intergenic (‑195/+112) | insA1 ← / ← rpsT | IS1 family protein InsA/30S ribosomal subunit protein S20 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 20703 | 0 (0.000) | 69 (0.650) +GCAAGAACCTGCAA |
36/570 | 2.0 | 100% | intergenic (‑195/+112) | insA1/rpsT | IS1 family protein InsA/30S ribosomal subunit protein S20 |
| ? | NC_000913 | 20704 = | 0 (0.000) | intergenic (‑196/+111) | insA1/rpsT | IS1 family protein InsA/30S ribosomal subunit protein S20 | |||||
ACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTACCTCAATGTGTATCACAATATCCATATTCTTTGTGGGGGAGTCTGGAGATTGAGTAGATATTCTTGTTCAGAATGTATCAGCCGATGGTTCTACGATTCTTAAGCCACGAAGAGTTCAGATAGTACAACGGCATGTCTCTTTTGACTATCTGGCAACCGGCAGTGTGTTCTCTCACGCATCACAAAAGCAGCAGGCATAAAAAAACCCGCTTGCGCGGGCTTTTTCACAAAGCTTCAGCAAATTGGCGATTAAGCCAGTTTGTTGATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAG > NC_000913/20534‑21002 | agtggtcttaagtttaatacctcaatgtgtatcacaatatccacattctttgtagggggtctggagattgagtagatattcttgttcagaatgtatcagccgatgnttctacgattcttaagccacgaagagttcagatagtacaacggcatgtctgcaagaacctgcaaCTTTTGACTATCTGGCAACCGGCAGTGTGTTCTCTCACGCATCACAAAAGCAGCAGGCATAAAAAAACCCGCTTGCGCGGGCTTTTTCACAAAGCTTCAGCAAATTGTCGATTAAGCCAGTTTGTTGATc < 2:760050‑M2/130‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |