| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,938,724 | IS2 (+) +5 bp | coding (498‑502/993 nt) | rbsR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 113 (1.020) | 81/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 92 (0.830) | 67/596 | 0.3 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3938724 = | 0 (0.000) | coding (498/993 nt) | rbsR | DNA‑binding transcriptional dual regulator RbsR | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/3185798‑3186391 | aGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGTTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGAc < 2:311305/300‑1 (MQ=255) aGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGAc < 1:406403/300‑1 (MQ=255) aaGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCAGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGNATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCNCTGAAt > 2:708752/1‑300 (MQ=255) aGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAAtc < 2:533620/300‑1 (MQ=255) aGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAAtc < 1:857599/300‑1 (MQ=255) aCTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCATGAATCTCCa > 2:8193/1‑300 (MQ=255) tAGGTACTCCGGTATTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACa < 2:339599/300‑1 (MQ=255) 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ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTATGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 1:107149/1‑300 (MQ=14) ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCAATTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCAGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCAAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:161321/1‑300 (MQ=14) ttattaGACTAGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTACCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGAAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTc > 2:776032/1‑300 (MQ=14) | GACAGCCAGAGCGGCGAAGTAACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACGTTCAACAATACCAACAGCTATCAGGAACTGAATTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCCACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTACAAGATTGCTTACGAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGATCGCAATTGTTCAGCAGAGCTTTGAACCGGGGATGACGGTCTCCCTCGTTGCCCGGCAACATGGTGTAGCAGCCAGCCAGTTATTTCTCTGGCGTAAGCAATACCAGGAAGGAAGTCTTACTGCTGTCGCCGCCGGAGAACAGGTTGTTC > NC_000913/3185798‑3186391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |