| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2578481 | 86 (0.770) | 20 (0.180) | 18/598 | 5.1 | 18.9% | intergenic (‑104/‑185) | maeB/talA | malate dehydrogenase (oxaloacetate‑decarboxylating) (NADP(+))/transaldolase A |
| ? | NC_000913 | = 2997691 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTT‑GTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGCTGT > NC_000913/2578185‑2578777 | cgccagttcgcccggatgttgggacttgaacngaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccanaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTTTGAg < 2:626549‑M1/7‑1 (MQ=255) aCCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCGAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTCGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGANATTCATGGAAATCAAGTGCACTTT‑GTNTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCa < 2:572300/300‑1 (MQ=255) gcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTTTGAGCAAGTCCaa < 1:570872‑M1/16‑1 (MQ=255) gTATATTTGTAGGCTTTTAACTGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTATACCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCGTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTAGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAAc < 2:52055/300‑1 (MQ=255) 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gACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAAGGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTTTCCGCCCGCGGCNCTATTGCGTCCATTCGCCATTCTCATCCCCAGGATGCCACCACCAATNCTTCGc > 2:728061/1‑300 (MQ=255) gACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGc < 2:482316/300‑1 (MQ=255) tttGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCATAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGCTGt < 1:246574/300‑1 (MQ=255) | TACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTT‑GTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGCTGT > NC_000913/2578185‑2578777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |