| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2578477 = | 92 (0.830) | 33 (0.300) | 31/596 | 2.8 | 26.4% | intergenic (‑100/‑189) | maeB/talA | malate dehydrogenase (oxaloacetate‑decarboxylating) (NADP(+))/transaldolase A |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
AGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTT‑GTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGC > NC_000913/2578181‑2578774 | gggTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTAGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCATGCAGGAGTCTACAGACtt > 1:819193/2‑300 (MQ=255) 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gcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTTTGAGCAAGTCCaa < 1:570872‑M1/16‑1 (MQ=255) gTATATTTGTAGGCTTTTAACTGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTATACCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCGTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTAGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAAc < 2:52055/300‑1 (MQ=255) gTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTTAGTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTAGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAAc < 2:53982/300‑1 (MQ=255) 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gACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAAGGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTTTCCGCCCGCGGCNCTATTGCGTCCATTCGCCATTCTCATCCCCAGGATGCCACCACCAATNCTTCGc > 2:728061/1‑300 (MQ=255) gACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGc > 1:339916/1‑300 (MQ=255) gACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGc < 2:482316/300‑1 (MQ=255) | AGGTTACCTCGGGCGGTATATTTGTAGGCTTTTAACGGGTCTTTTTCGATTTCAAGACAAGGTGCGGCAACGCCTGGTGAGTAGGCCAGCGCCAGATCGCGCTGTGTTGCCAGAGGCTTGGTTGGAGAAACCTGGATTTTCCCTGGAACTGGAAATTCATGGAAATCAAGTGCACTTT‑GTTTTAACTGGTCATCCATTTGGTTGTTCCTTTCACGTAACGTTCACAAATAAAGTGTGTGGGCAACAGCCCCTGCCCACAACGTGGCGCACATTATTACCCTGCCGGAGTCTACAGACTTTGAGCAAGTCCAAACTCTCACCATTAATATAATGTTTTGGTAATAATCCTATAACACTGATGTTACCTGCTTAATCCAGCAATACCATGCCTGTCTGCTATGCTTTTTTGATGCGTTTAGCGAAATTTCTCAGAAGTGTGAATTAACGCACTCATCTAACACTTTACTTTTCAAGGAGTATTTCCTATGAACGAGTTAGACGGCATCAAACAGTTCACCACTGTCGTGGCAGACAGCGGCGATATTGAGTCCATTCGCCATTATCATCCCCAGGATGCCACCACCAATCCTTCGC > NC_000913/2578181‑2578774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |