Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,291,151 | IS5 (–) +4 bp | coding (910‑913/1014 nt) | rssB → | regulator of RpoS |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
ATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGCCAGCGATGCGATGCCTGGCAATGCCAAATATGGGGAACCGGTGGTCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATACTGGGATGCGATACAGAAATATGAACACGTTCAAAACACGAACAGTCCAGGAG > NC_000913/1290852‑1291449 | aTGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAACATCAACGGTTGCAAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCCCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGACCACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACtt > 2:390430/1‑300 (MQ=255) 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ATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCTATTAGTTGGCTATTATCATCGCGAACTGAAAAATCTCATTCTGGTTTCTGCGGGTCTGAATGCGACGTTAAATACCGGCGAACACCAGGTGCAAATCAGTAATGGTGTTCCGTTAGGCACTTTAGGTAACGCTTATTTGAATCAATTGAGCCAGCGATGCGATGCCTGGCAATGCCAAATATGGGGAACCGGTGGTCGACTGCGCTTGATGTTGTCTGCAGAATGAGCAAACGATAACGCGGGCTAAATTTGCATTACCTGCTAATGTCGGCTGGTGGTACTATCGTCGCCATTCGTATAAGTAATTGTCTTAATTATGCTAACTCGCCTCCTTTTCAGAACTTAGCCCCTTCGGGGTGCTGATATACTGGGATGCGATACAGAAATATGAACACGTTCAAAACACGAACAGTCCAGGAG > NC_000913/1290852‑1291449 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |