| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 58 (0.520) | 8 (0.080) | 7/558 | 8.3 | 10.3% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 85 (0.820) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NC_000913/1286792‑1287379 | cAAGTCGAACTTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTGTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgc < 2:415002/300‑1 (MQ=255) aGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATCTTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTNCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCNCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgtgc < 2:701677/300‑4 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCt > 1:172397/1‑300 (MQ=255) aaCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:292510/300‑1 (MQ=255) ggTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGGGAGTCCAGAGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGAGAAGGATTACTccctgccacgcgcttag > 2:455282/1‑284 (MQ=14) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCggg > 1:444477/1‑300 (MQ=255) gAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTNCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctctct > 1:632103/1‑300 (MQ=255) atatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGCTTCGCTTGAGAGTTTAGGGACTTTTGAAAGTGGTGGTGGTGGGAGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCg > 2:568466/1‑300 (MQ=255) atatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGTCGAGTATTTGATTGCAGATTTGCTTGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGCTGGTGGTGGGGGACGGATTCATCCGCACTACACTCCCCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCg > 2:568355/1‑300 (MQ=17) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGTGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGc < 1:213319/300‑1 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTGGAGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGt < 1:478326/300‑1 (MQ=255) ttCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGTAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCCTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAAACTTGGTCGa > 1:77795/1‑300 (MQ=255) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCa > 1:692145/1‑300 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAt > 1:751251/1‑300 (MQ=255) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCCTCACCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAACCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATCCACCTGCAAACTCACCCGAGAATTCAAGTAATCTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGAGCGCTTAGAACTTAGGGTCGTTGCATGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGTTTCTCATCCTTaccc > 1:859380/1‑300 (MQ=14) tggtagttggtgaatgattgtcccacgcTGCGCGCTTCGCCTTGCGGGGCGCGGTCTGCGGCAACGCGCGCGCGCCGACGATCGAGCCGAACTTTAGTCGCAGCTTATCACCCTTCACCGCGTGGGCAGAATATGTGATTGTGGATTCGTGTGAGAGTTCAGGGATTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:149646/275‑1 (MQ=14) gtggtggGGGGAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTACGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCAGCATGGGCAGAATATTTGCTTGCGGATTCGCTTTAGCGTTCAGGGACTTTTTAAAGTGGTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGCTGCCTGCAGCAACGCTCTCTCGCTTG‑CACTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGTTTCTCCTCCTTCCCCACATg > 1:461498/1‑300 (MQ=17) ggAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAat < 1:324059/300‑1 (MQ=255) ttACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAt > 1:840369/1‑300 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCATCGCTGCGCGCTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGATGA‑CGCTCGCGNCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCCCGGGTAGAACATNTAATTg > 2:714932/1‑300 (MQ=14) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTg > 1:378641/1‑300 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCACATGGGCAGAATATTTAATTg > 1:443243/1‑300 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCCGCTCTGCGTTCCTAGCACTCAGGGTCGTTGCATACAGCAACACTCTCTCGATGA‑CACTCAAGTAGAACCTTGGTCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGCATGGGAAGAATATGTAATTg > 1:242392/1‑300 (MQ=14) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCNTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCNCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACCCAGCGCTGCGCGCCTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTACGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGACGTCTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATTTAAGTGCGGAt > 2:628253/1‑300 (MQ=17) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAAGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACACGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAt > 1:176784/1‑300 (MQ=255) gcgatGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCATGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGAAGAATATTTAATTGCGGAt > 1:176829/5‑300 (MQ=255) ttCGCCCTTCGGGTCGTTGTCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCGTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑Ag < 1:271195/300‑1 (MQ=255) ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAANCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGGTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGTTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGG‑CACTCGAGTCGAAAATTAGTCGAAGTCTCTCATCCNTACCAGCATGGGGAGAGTAGTTCATTGCGGATTCG‑TTGTGA‑AGTCCAGGGagtg > 2:805490/1‑297 (MQ=17) 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aCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc > 1:255434/1‑300 (MQ=255) gTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGTAGAATATTTAAGTGCGGATTCG‑CTGGGA‑CGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATCCGAACCTTAGAAGTCGATGAc > 2:497941/1‑300 (MQ=17) cTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGCGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGAAGAACATTCAATTGCGGACCCG‑CTGGGA‑CGTCCAGGGACTGTTCAACATGATGGTGGTGGGAGAAGGCGTCGCACCCTCGAAGTCGATGaagacaact > 2:285775/1‑292 (MQ=17) cTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAt > 1:87352/1‑300 (MQ=255) cTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGAAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGCACCTTCGCAGTCGACGACGGCAGAt > 1:692766/1‑300 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGACGCTTCTCCTCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTACTTGCGGATTTG‑TTTGGC‑AGTTTAGGGGTTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGAGGGAGGATTCGACCCTTCGAAGCCGATGACGGCaaagt > 2:56790/1‑296 (MQ=17) 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atatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGTAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGACAGATTTACAATCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg > 2:194805/1‑300 (MQ=255) gCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGGCGAACCTTGTTCGAAGCGGCTTATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGt < 2:662064/300‑1 (MQ=21) cTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTa > 2:443860/1‑300 (MQ=255) ttgattatttaaggaagcgATGGTGGTGTGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGTGTCGTTGTCTGCGGCAACGCTCTCGCGCGGG‑CGCTCAAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGTCAGAAGATTGGATTGCGGATTCG‑T‑GGGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAAttt < 2:566594/282‑1 (MQ=17) cTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGGCGAATATTTAATTGCGGACTCG‑TTGGGA‑AGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGNTGGTGGTGGGGGAAGTATTCGCCCCTCCGCCGCCGACGACGGCATCCTCACATTCTGCTCCCTTTAGCCACTCGAAAACCCCACCA‑gggatcactccccctttgcagtc > 1:631166/1‑280 (MQ=14) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTg < 1:577078/300‑1 (MQ=255) gTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgag < 1:858773/300‑1 (MQ=255) tGATGGTGGTTGGTGAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCTGGTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCG‑TGGACGCTCGAGTTGGACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATGTAATTACGGATTAG‑TGGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:433732/300‑1 (MQ=25) tGATGGGGTTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCTAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:275409/300‑1 (MQ=255) cgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGNTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CCCTCGAGGCGAACCTTGTTCGAAGCTTCGCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGG‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:647614/299‑1 (MQ=255) tggtggGGGAAGAATGACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGA‑CGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCTCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtgg < 2:383962/300‑1 (MQ=18) gggtaaGGAGTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTgggg < 2:124294/296‑1 (MQ=255) 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CAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGG‑CGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCG‑TTGGGA‑AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NC_000913/1286792‑1287379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |