Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 293,207 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑259/+9) | yagK ← / ← yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 293211 | 0 (0.000) | 104 (0.940) | 65/596 | 0.4 | 100% | intergenic (‑263/+9) | yagK/yagL | uncharacterized protein YagK/resolvase‑like catalytic domain‑containing protein YagL |
? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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GGATATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAACAT > NC_000913/292912‑293507 | gATATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCt > 1:715586/1‑300 (MQ=255) tatGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGGTGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTANTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGAAGAAGGTAGCCCCAGCATGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtgg > 2:213388‑M1/1‑297 (MQ=255) tatGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtgg > 1:3180‑M1/1‑297 (MQ=255) tatGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACATGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACGTACTGATCTGATTACTACTCTTAATGGTGAATACCGGTAGTAAGAGTAGACAATGCCATTATATAATAACTATCCAACATCTAAATTCGCGACGGAGGTAGTCCCATCATGTGATGGCTGTTGAAAAGTTACTCTGAAATTAGCtgg > 2:7835‑M1/1‑297 (MQ=255) atatGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTTTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagac < 2:121988‑M1/300‑26 (MQ=255) cagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagagagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGtt < 1:216585‑M1/31‑1 (MQ=255) ctgcgggatgtgtataagagacaggtctatagcagaccgtacagggatGCCATACAGGCAGGGATATTCCTGGTCCCTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTCGTACGGACATACCGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCATGTGATGGATGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagacacctgttatcactt > 1:190078‑M1/24‑261 (MQ=255) 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attgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccttcatccccggttcaaaactctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGt > 2:424252‑M1/249‑300 (MQ=255) ggTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc < 1:306605‑M1/300‑55 (MQ=255) gTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 1:196873‑M1/1‑237 (MQ=255) 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GGATATGTACTCCATGAGTACCTTGATATGTTTTCATAATATATACCTGTATTTGGTCCTACGGTCTATAGCAGACCGTACAGGGATGCCATACAGGCAGGGCTATTCCTGGTCACTGTTGTCGGTATATACTGGTATCAGATTTTAGTACGGACATACTGATCTGATTACTACTCTTACTGGTGAATACAGGTAGTAAGAGTACACAATGCCATTATATAATACCTATCCAACATCTAAATTTGAGACGAAGGTAGCCCCAGCCTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTATCCTTGAAGCTGGATGGTAGCTGTAGATAAACAT > NC_000913/292912‑293507 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |