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TTGAGTTCGGGAGGAGTTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGT < 1:36430/300‑1 TTCGGTAGGAGGTAACGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTT < 2:409325/300‑1 GGAGGAGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACC < 1:98925/300‑1 AGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATNCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACNTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACCGAAGA < 2:583102/300‑1 AGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACCGAAGA < 1:470313/300‑1 AGGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGCCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACCGAAGA < 1:327412/300‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2170373‑2170171‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTACTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACCTTGTCATGCAACTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTAACTTCCGTCCCAGCCTTGCCAGATGTTGTCTCAGATTCAGATTATGTCGCTCAATGCGCTGAGTGTAACGCTTGCTGATAACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGTGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCTATACCACGACCTCAAAGGCCGACAGCAGGCTCAGAAGACGCTCCAGTGTGGCCAGAGTGCGTTCACCGAAGA < NC_000913/4519239‑4518941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |