| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,584,325 | C→T | R721H (CGC→CAC) | ydeP ← | putative oxidoreductase YdeP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,584,325 | 0 | C | T | 99.2% | 440.8 / NA | 119 | R721H (CGC→CAC) | ydeP | putative oxidoreductase YdeP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (59/59); minor base G (0/1); total (59/60) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GAAAAGAGGAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGCGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATCTATCCATGCGGCGTGAGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATACCATAAATCGTCGTGTTGTACTGATCGTGGCTGCGTACTGTCGCCATGACCAGCTTACTGTTAAACGCTGAAGAGGGATCTTCTAACAGCCCTTTGCTGGTAATGAAAT > NC_000913/1584029‑1584619 | gaAAATAGTAAATAGGACTGGTGCTTCAGTACTGAGCGGAGTTTCTTACAGCTGTAGGCAGAAGTTTATATCTTATAGTATGTAGTTTAATTTAATCCATGTGAGCAAATTGCGAAATAATAGTCAATGAGGAATTCTTCTGCTGTGCGGATGACAGCAGAAGAAATGAGAAGAGGCATTAATTTGATGGTTCTAATTCAACCGGAATACTTTTATAGCCAGGAATGCCACTTAATGGATCGTGGTTATCAAGTGTTAGCATGTGATTCGATTCTGGAAAATAGGTCACCAGTGAGTGGt < 2:19985/300‑1 (MQ=255) 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tCACCAGTGAGTGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATCTATCCATGCGGCGTGAGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCATAGATAGCGATCATCCATACCATAAATCGTCGTGTTGTACTGATCGTGGCTGCGTACTGTCGCCATGACCAGCTTACTGTTAAACGCTGACGAGGGATCTTCTACCCGCCCTTTGCTGGtca > 2:766144/1‑298 (MQ=255) aCCAGTGAGTGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATCTATCCATGCGGCGTGAGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTCACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATACCATAAATCGTCGTGTTGTACTGATCGTGGCTGCGTACTGTCGCCATGACCAGCTTACTGTTAAACGCTGAAGAGGGATCTTCTAACAGCCCTTTGCTGGTAATg > 1:379278/1‑300 (MQ=255) aCCAGTGAGTGGTCAGCCATAGGGTAAATGACCACTTTTAATCTATCCATGCGGCGTGAGCTGCGCTTACCGTCTGGCGTAAGCGCAATAAGATTAACTCTTTCGCCGTTTTTTACACGGCAAATTTTAGCTTGTTTAGCACTCATAAAGACCACATCTCGTTGACCGAATACCCCTCGATAGCGATCATCCATACCATAAATCGTCGTGTTGTACTGATCGTGGCTGCGTACTGTCGCCATGACCAGCTTACTGTTAAACGCTGAAGAGGGATCTTCTAACAGCCCTTTGCTGGTAATg > 1:8859/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |