| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,829,661 | G→A | M239I (ATG→ATA) | xanP → | xanthine:H(+) symporter XanP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,829,661 | 0 | G | A | 99.0% | 380.2 / NA | 104 | M239I (ATG→ATA) | xanP | xanthine:H(+) symporter XanP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (44/59); minor base C (1/0); total (45/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAATTGCGATGGCGGCCGGATATGCGCTGGCGTGGTTTATGGGCATGTTGCCAGAAAGCAACGAACCTATGACGCAAGAACTGATTATGGTGCCAACGCCGCTCTATTACGGTCTTGGCATTGAATGGAGTCTGCTGCTGCCGCTGATGCTGGTCTTTATGATCACTTCGCTGGAAACCATTGGCGATATCACGGCGACCTCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAA > NC_000913/3829366‑3829954 | gCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAATTGCGATGGCGGCCGGATATGCGCTGGCGTGGTTTATAGGCa > 1:7933/1‑300 (MQ=255) 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ggTTTATAGGCATGTTGCCAGAAAGCAACGAACCTATGACGCAAGAACTGATTATGGTGCCAACGCCGCTCTATTACGGTCTTGGCATTGAATGGAGTCTGCTGCTGCCGCTGATGCTGGTCTTTATGATCACTTCGCTGGAAACCATTGGCGATATCACGGCGACCTCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCaaa > 2:448417/1‑300 (MQ=255) gTTTATAGGCATGTTGCCAGAAAGCAACGAACCTATGACGCAAGAACTGATTATGGTGCCAACGCCGCTCTATTACGGTCTTGGCATTGAATGGAGTCTGCTGCTGCCGCTGATGCTGGTCTTTATGATCACTTCGCTGGAAACCATTGGCGATATCACGGCGACCTCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCaaaa > 1:177476/1‑300 (MQ=255) gTTTATAGGCATGTTGCCAGAAAGCAACGAACCTATGACGCAAGAACTGATTATGGTGCCAACGCCGCTCTATTACGGTCTTGGCATTGAATGGAGTCTGCTGCTGCCGCTGATGCTGGTCTTTATGATCACTTCGCTGGAAACCATTGGCGATATCACGGCGACCTCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCAGAACTCCTGCTTCGGGCaaaa > 1:546418/1‑300 (MQ=255) | GCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAATTGCGATGGCGGCCGGATATGCGCTGGCGTGGTTTATGGGCATGTTGCCAGAAAGCAACGAACCTATGACGCAAGAACTGATTATGGTGCCAACGCCGCTCTATTACGGTCTTGGCATTGAATGGAGTCTGCTGCTGCCGCTGATGCTGGTCTTTATGATCACTTCGCTGGAAACCATTGGCGATATCACGGCGACCTCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAA > NC_000913/3829366‑3829954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |