| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,826,233 | G→A | A342T (GCA→ACA) | recG → | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,826,233 | 0 | G | A | 99.0% | 346.0 / NA | 98 | A342T (GCA→ACA) | recG | ATP‑dependent DNA helicase RecG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (44/53); minor base C (1/0); total (45/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CACAGCGTTTTCATGCCCAGCCGCTGAGCGCCAATGACACGCTGAAAAATAAACTCCTCGCCGCCTTACCGTTCAAGCCAACGGGCGCACAGGCACGCGTAGTGGCGGAGATCGAGCGCGATATGGCGCTGGATGTGCCGATGATGCGTCTGGTGCAGGGCGATGTAGGTTCCGGTAAAACGCTGGTCGCCGCCCTCGCCGCGTTGCGTGCGATTGCCCACGGCAAACAGGTAGCATTGATGGCACCAACCGAATTACTCGCCGAGCAGCACGCCAATAACTTCCGCAACTGGTTTGCACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGT > NC_000913/3825937‑3826527 | tacaGCGTTTTCATGCCCAGCCGCTGAGCGCCAATGACACGCTGAAAAATAAACTCCTCGCCGCCTTACCGTTCAAGCCAACGTGCGCACAGGCACGCGTAGTGGCGGAGATCGAGCGCGATATGGCGCTGGATGTGCCGATGATGCGTCTGGTGCAGGGCGATGTAGGTTCCGGTAAAACGCTGGTCGCCGCCCTCGCCGCGTTGCGTGCGATTGCCCACGGCAAACAGGTAGCATTGATGGCACCAACCGAATTACTCGCCGAGCAGCACGCCAATAACTTCCGCAACTGGTTTacac < 2:282335/299‑1 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cAACTGGTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCGCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACTGCTTGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGAc < 1:380328/300‑1 (MQ=255) ggTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGNCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATNTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGt > 2:690502/1‑300 (MQ=255) ggTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACTGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGANCAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACNCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGt < 2:715190/300‑1 (MQ=255) ggTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCCGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTCTCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACCGCGt > 2:27682/1‑300 (MQ=255) ggTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATNTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCATGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTNTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCACCGCACGCTGGCAATGAATGCGt > 2:802590/1‑300 (MQ=255) ggTTTACACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGt > 1:93754/1‑300 (MQ=255) | CACAGCGTTTTCATGCCCAGCCGCTGAGCGCCAATGACACGCTGAAAAATAAACTCCTCGCCGCCTTACCGTTCAAGCCAACGGGCGCACAGGCACGCGTAGTGGCGGAGATCGAGCGCGATATGGCGCTGGATGTGCCGATGATGCGTCTGGTGCAGGGCGATGTAGGTTCCGGTAAAACGCTGGTCGCCGCCCTCGCCGCGTTGCGTGCGATTGCCCACGGCAAACAGGTAGCATTGATGGCACCAACCGAATTACTCGCCGAGCAGCACGCCAATAACTTCCGCAACTGGTTTGCACCGCTCGGTATCGAAGTGGGCTGGCTCGCCGGTAAGCAGAAAGGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGT > NC_000913/3825937‑3826527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |