Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,759,088 | G→A | A258A (GCC→GCT) | selB ← | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,759,088 | 0 | G | A | 98.9% | 326.8 / NA | 92 | A258A (GCC→GCT) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (52/39); minor base C (1/0); total (53/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAGCCATTGCAGATATTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCACTTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACCAGCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGC > NC_000913/3758793‑3759379 | ccagccaTTGCAGATATTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCaa < 1:947233/300‑1 (MQ=255) agccaTTGCAGATATTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAagc < 1:755144/300‑1 (MQ=255) aTTGCAGATATTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGACGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGcc < 1:815718/300‑1 (MQ=255) gCAGATATTCCTGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGAAGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGt < 1:925569/300‑1 (MQ=255) tatTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGATCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACACGTGTGAACGGCTCTGGCGGTACATCAGCAAGCCGCCAGTCGCCa > 2:150619/1‑300 (MQ=255) tatTCAGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCGCGCAATACCAGGCGGTCGTTATTTGCCAGCCATAAAGGGGTGTCGAAGACCAATTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCa > 2:475093/1‑300 (MQ=255) atTCCGGCTTACGTTTACCGCGACGCGGCGGGTTAAGCATCACGACGCGCGCTCCGGCCAGCGTGTTGCGGGCAGAGATATCTCGCAATACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCAc > 1:946611/1‑300 (MQ=255) 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aTACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCAACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCCCCCGCGATGTTACGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTgcg > 2:108393/1‑300 (MQ=255) aTACCAGGCGGTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCAGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGTGGCTGCCGCTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCAAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTgcg > 2:222766/1‑300 (MQ=255) gTCGTTATCTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAgcgc > 2:408177/1‑300 (MQ=255) 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cTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTacac < 1:95070/300‑1 (MQ=255) cTGCCAGCCATAACGGGGTGTCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCAGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGACAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTacac < 1:786781/300‑1 (MQ=255) gtCGAAGACCAGTTCAGCAAGGTTATCTTCCNGCAGTGAAACGCGTCCCGTGACGTGGCTGGCGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACANTCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCAGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACAcc > 2:700241/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |