| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,698,773 | G→A | G187D (GGC→GAC) | bcsG → | cellulose phosphoethanolamine transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,698,773 | 0 | G | A | 99.2% | 431.2 / NA | 119 | G187D (GGC→GAC) | bcsG | cellulose phosphoethanolamine transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (66/52); minor base C (1/0); total (67/52) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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aGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTAGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAg < 1:343136/300‑1 (MQ=255) aGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATCCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGNTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAANTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAg < 2:651165/300‑1 (MQ=255) gCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGt < 1:786659/300‑1 (MQ=255) ttGCGGCGACGGGTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGTCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCcggcgg < 1:224368/300‑1 (MQ=255) gggTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCCTCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTCCAGTGGCCCGGCGGCGATCCGttt > 1:246172/1‑300 (MQ=255) gggTGACGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGttt > 1:339182/1‑300 (MQ=255) | AAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAATGGATTCGCATTACCGTTTTTGTGGTTGCCATACTGCTATGGCTGAACGTACTTACCCTGGCGGGACCAAGTTTCTCCTTGTGGCCAGCCGGACAACCGACGACCACTGTAACAACGACGGGTGGTAACGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTT > NC_000913/3698479‑3699067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |