| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,570,589 | C→T | G388D (GGC→GAC) | eutE ← | acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) EutE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,570,589 | 0 | C | T | 98.6% | 266.5 / NA | 73 | G388D (GGC→GAC) | eutE | acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) EutE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (51/21); minor base G (0/1); total (51/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTGCAGACGTGGGGTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGCCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACGCGCACGACGGGCAACACCGGCATCATCAGTTCAGTCACGGCAAACGGATGTTCTGCGGTGGTTTCCACAAACAGCAGGCGCGTTTCTTGCGGAACTTTAAGGCCGATTGCCGCCGCGATTTTGCCTGCGTCGCGACCAACCCAGTCACGGCTGACGGTGCCTTTTCCGCGCTCGTCGATATTTTTCAGCAACACCGGTTGCAGCTGCTGCGCCTGTTCTGCGGTCAGTTTCACCGCGTGCTGGCC > NC_000913/2570299‑2570881 | ttGCAGACGTGGGGTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTTATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGtt > 2:336234/1‑300 (MQ=255) gACGTGGGGTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGNTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCTAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCTGGCAATGCACNGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTATTCCAGTTTCAcc > 2:802149/1‑300 (MQ=255) ggggTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCNTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAg > 1:699818/1‑300 (MQ=255) gggTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCACCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAACGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGTTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCTAGTTTCACCGCTAgc > 2:325355/1‑300 (MQ=255) gggTGAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGNGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGNTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAgc > 2:796928/1‑300 (MQ=255) ggTGAGCCATTGTTCGTCATGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAgcg < 1:86849/300‑1 (MQ=255) gAGCCATTGTTCGTCGTGCGCCATCTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCaa < 1:810529/300‑1 (MQ=255) 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cTGTTACTCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGAcgc > 1:61099/1‑300 (MQ=255) tCCTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACGCGCacgac < 1:20019/300‑1 (MQ=255) ccTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGTCTTCCCCGACCAGCCCCAGCCCGGCAGTGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACACGCacgacg > 2:266077/1‑300 (MQ=255) ccTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCCTTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACGCGCacgacg > 1:213832/1‑300 (MQ=255) ccTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCATGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTCATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCTTCCAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACGCGCacgacg > 1:213740/1‑300 (MQ=255) ccTTAAACAATGCGAAACGCATCGACTAATACACAGCGACGCAGACGGACAAACGTACGCGCGCTGGTTACCCCTTCACCGGTTGGCGTGGTGATGGTCACGGTGGTCCAGCCTTCCCCGCCCAGCCCCAGCCCGGCAATGCACGGTCCGTTCTTAACGAAAATGCTGGTATCAATAGCATTCGCCATCTGGTTTATGTTTTCGATGTTGCGCGAGTGCATTGCCGCCGTGTGGTGGCAACCGTCNTCAAGTTTCACCGCTAGCGCAATGGCATCCGCCACGTTGGCGACGCGNacgatg > 2:806095/1‑298 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |