Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,177,268 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑64/+236) | gatY ← / ← fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2/fructose‑bisphosphate aldolase class I |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2177276 | 0 (0.000) | 117 (0.950) | 79/598 | 0.2 | 100% | intergenic (‑72/+236) | gatY/fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2/fructose‑bisphosphate aldolase class I |
? | NC_000913 | 4518472 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GTGATGTGTGCCATAAAGCGACTCGAACGTTAAGGAAGCTGTGGTAGTGGCGCGGTCAGACATGCGGAGTGCATCAAAAGTTAATTATCACGTAGTCATATTAATATGAGAATGGTTATCATTACAATTGGAAATAAAATTGTTTCCAATAGACATTTTTAACATGTTGTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGGTTTTAC > NC_000913/4518173‑4518770 | gatggtgatattgcttcgccatcgcgctgaccagcgccaacagattttctgtaccagcatgagtaaatgtgccaggcgttccggcgatgatgaccggcgcatgcaggttggcagcggtttctaccaccacttgcatcgtttcgagattgtgaatattgaatgccggaaccgcataaccgccgcgctgtgcgttgttcagcatctgctttgtcgataccacgtacattttcatatcctgtcgtttgttttcgatttcaaaatataatgaaattatttgtttttaaatatcgagataacggg < 1:359338‑M2/2‑1 (MQ=255) 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aaaGGATGTGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACGCATTATGGGCGTTGGcc < 2:542359/300‑1 (MQ=255) aacgGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGGttt < 1:801335‑M2/296‑1 (MQ=255) gGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGNACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGNTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCAACAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGGTTTTAc > 2:655914‑M2/2‑300 (MQ=255) | GTGATGTGTGCCATAAAGCGACTCGAACGTTAAGGAAGCTGTGGTAGTGGCGCGGTCAGACATGCGGAGTGCATCAAAAGTTAATTATCACGTAGTCATATTAATATGAGAATGGTTATCATTACAATTGGAAATAAAATTGTTTCCAATAGACATTTTTAACATGTTGTTTTTCTAAGTGTTATAAGGTAGGTATAAAATGGGATGGAGCCTCTGCTTCTGGCATGTGTCGGTCAGAATGACTCATGATGTGGTCTGCTATTATTGACATCCTCACTGCCCTAAAGGATGGGGATTTCGGTAATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGATTTTAAGGTGCTTGCGTGGCTTCCATTTCCATCAGATGTCCTTCCTGCTCCGCTACTGAAGGCGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCTTGCCGTAAAACATGGCAACTACAGTTCACTTACACCGCCTCTCAGCCCGGTAAGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTCGGATGTCGCGCCAGTGCACGCATTATGGGCGTTGGCCTCAACACGGTTTTAC > NC_000913/4518173‑4518770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |