| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,049,306 | IS1 (+) +8 bp | coding (20‑27/645 nt) | gfcB ← | lipoprotein GfcB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 142 (1.160) | 85/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1049313 | 0 (0.000) | coding (20/645 nt) | gfcB | lipoprotein GfcB | |||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GAATTTGTCACTTCCAGCAGATTATTATTAAGTTTGACGGTTTTTAAAAGACGTCCATTGTGGGTAACCAGCATGGCGTTATCCTGGGATAACCATTTGCTTTGTTCTTGTTCTATATATCCCAGTACCACAAAGATTCGTTGCCCTTCATTAAGGCGTAAATACATAGTGGAATAAGGCAACGCCTGGATCTGCTGATCCGCTACGGTGATATCCTGATTATCGAAAAGGCTGGCGCGAAATGTATCGACCATACTTTGCTGGCTGTGCGTACATCCCGCAAGAAATAGTGCGAAAATCGATAAAATAAGAGGGCGCACCTTTAATCCTTGAAAGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCATTTAACTTTAATTTCGACGCGTTAAAGCAGTATTAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTTGCTGCAACAACTGCCAACGTCGCCACACCAACAGCCGTTGCCACACCGACAACTGTCGCCGTGCCGACAGCGCCAGCAGCCACGCCACCAGTGGTAGTAGCAG > NC_000913/1049013‑1049602 | gAATTTGTCACTTCCAGCAGATTATTATTAAGTTTGACGGTTTTTAAAAGACGTCCATTGTGGGTAACCAGCATGGCGTTATCCTGGGATAACCATTTGCTTTGTTCTTGTTCTATATATCCCAGTACCACAAAGATTCGTTGCCCTTCATTAAGGCGTAAATACATAGTGGAATAAGGCAACGCCTGGATCTGCTGATCCGCTACGGTGATATCCTGATTATCGAAAAGGCTGGCGCGAAATGTATCGACCATACTTTGCTGGCTGTGCGTACATCCCGCAAGAAATAGTGCGAAAATc > 1:80325/1‑300 (MQ=255) cactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAAAATCGATaaaa > 1:199381‑M2/287‑300 (MQ=255) ctatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGAAAATCGATAAAATa > 1:375734‑M2/285‑300 (MQ=255) cTTCCAGCAGATTATTATTAAGTTTGACGGTTTTTAAAAGACGTCCATTGTGGGTAACCAGCATGGCGTTATCCTGGGATAACCATTTGCTTTGTTCTTGTTCTATATATCCCAGTACCACAAAGATTCGTTGCCCTTCATTAAGGCGTAAATACATAGTGGAATAAGGCAACGCCTGGATCTGCTGATCCGCTACGGTGATATCCTGATTATCGAAAAGGCTGGCGCGAAATGTATCGACCATACTTTGCTGGCTGTGCGTACATCCCGCAAGAAATAGTGCGAAAATCGggtgatgct > 1:292433‑M2/1‑291 (MQ=255) 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GAATTTGTCACTTCCAGCAGATTATTATTAAGTTTGACGGTTTTTAAAAGACGTCCATTGTGGGTAACCAGCATGGCGTTATCCTGGGATAACCATTTGCTTTGTTCTTGTTCTATATATCCCAGTACCACAAAGATTCGTTGCCCTTCATTAAGGCGTAAATACATAGTGGAATAAGGCAACGCCTGGATCTGCTGATCCGCTACGGTGATATCCTGATTATCGAAAAGGCTGGCGCGAAATGTATCGACCATACTTTGCTGGCTGTGCGTACATCCCGCAAGAAATAGTGCGAAAATCGATAAAATAAGAGGGCGCACCTTTAATCCTTGAAAGGTTAATTAAAAAAATGCAAATCTCTAAAGCCCGGTACGAATATCGCAACCGGGTATCATTTAACTTTAATTTCGACGCGTTAAAGCAGTATTAGCGTGTAGTGGACGTGGTGGTTGAGGTGTTATGAGAACCGCCATCGCCACTGTCATTTGCTGCAACAACTGCCAACGTCGCCACACCAACAGCCGTTGCCACACCGACAACTGTCGCCGTGCCGACAGCGCCAGCAGCCACGCCACCAGTGGTAGTAGCAG > NC_000913/1049013‑1049602 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |