| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 656016 | 144 (1.170) | 14 (0.110) | 14/598 | 6.4 | 8.9% | intergenic (‑48/‑541) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuC/Lipid A palmitoyltransferase |
| ? | NC_000913 | 687851 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
ATAATCATCATGCCGAGGTCGCCGCCGCGGCTCATTAGTAATATTTTAACGTATTCAACGATATCCGTGGCGCTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAA > NC_000913/655718‑656309 | atAATCATCATGCCGAGGTCGCCGCCGCGGCTCATTAGTAATATTTTAACGTATTCAACGATATCCGTGGCGCTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCACAATAAGGAGTTCAATGAATGTCAGCATAATCTTTCCTGTCTCCAGGCACCAAAGTAAATAATAAAAAATCCCTaaa > 2:347197/1‑300 (MQ=255) gCTCATTAGTAATATTTTAACGTATTCAACGATATCCGTGGCGCTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACANCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTNAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAAtt < 2:707920/300‑1 (MQ=255) tAATATTTTAACGTATTCAACGATATCCGTGGCGCTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGaa < 2:760030/300‑1 (MQ=255) gcTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAg > 2:636573/1‑300 (MQ=255) gcTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTACAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTACGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTACAACCAAGAAAAACTGCCATTAAg > 2:203685/1‑300 (MQ=255) gcTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCAAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAg > 1:852664/1‑300 (MQ=255) tGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAg < 2:836794/300‑1 (MQ=255) 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ataaAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGAGGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtct < 2:349200/300‑1 (MQ=255) ataaAAAATTCCGAAAGCGTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTACTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTAtct < 2:321230/300‑1 (MQ=255) ttCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTaaaa > 1:497967/1‑300 (MQ=255) | ATAATCATCATGCCGAGGTCGCCGCCGCGGCTCATTAGTAATATTTTAACGTATTCAACGATATCCGTGGCGCTGTAGCCTGTTGAAGCCTGGCTGGACGGTAACACTTTGTGCCCCATAATGGCACTGATAATCAGCAATAACAGGCCACCGACAAATAACACACCAGTGGCGGAATACCCTTTAATGATGTAGCGAGCTACACCCACAATAACCACAACCCCAATAAGGAGCTCAATGAATGTCAGCATAATTTTTCCTGTCTCCAGGCCCCAAAGTAAATAATAAAAAATTCCTAAAGCTTAAGGAAAAAATATGCCCAATAAATTGGCGATGAATGCTGATTAAAATCAAGAAAAACTGCCATTAAGACATTGAAGTTGCTGTTTTTATACATAGATAACAAAACGCATATTTAGCGGTTGGCAATTATCACATAATAATGTGTGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAA > NC_000913/655718‑656309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |