| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3064082 | 135 (1.100) | 24 (0.200) | 21/598 | 4.7 | 15.1% | coding (90/786 nt) | scpB | methylmalonyl‑CoA decarboxylase |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATCGGTGGAATGGCTGCGTAAGCAGACCGAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3063805‑3064082‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCAAAATGAGCATTC < NC_000913/4508679‑4508386 ATCGGTGGAATGGCTGCGTAAGCAGACCGAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACACTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGC < 2:163403/300‑1 GGAATGGCTGCGTAAGCAGACCGAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTNTCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGNATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGT < 2:684182/300‑1 AATGGCGGCGTAAGCAGACCGAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATGACCGCCAGACGCTTTTAGCATTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCNGCTCAGTGAATTCATCCATACGCAATACTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCCTATCAGTATGTTAACGTCGTCACTATCAACAGAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTGTGGCCTAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTA < 2:249167/300‑1 GAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCG > 2:944648/1‑300 ATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAG < 2:558378/300‑1 aaCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGTTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAccc < 2:428555/298‑4 ATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTG > 1:977841/1‑300 atACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTAGCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATTTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATTAGACAAACATTTACAGCATAGGAAAAACCCTCTGTTTTTGAAC < 2:313129/298‑1 tgtataagagacagCCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGANGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAANATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCT < 2:912662/286‑1 ACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAGTTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCT < 2:152963/300‑1 ACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGT < 1:157010/300‑1 TCTCACCGCGCACCTGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAA < 1:287236/300‑1 CCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTctgtctcttataca > 1:937850/1‑286 CCAGACACAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTACCGTTGTCACTATCAACAAATTGTCGTTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATGTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCAC < 2:421059/300‑1 caCAATATTTTGATGAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAGTTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCATAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGT < 2:262783/298‑1 TTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGG < 1:798964/300‑1 TTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAG < 1:206500/300‑1 TTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATGGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAAGGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAG < 2:38185/300‑1 GTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAG > 1:363027/1‑300 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GTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCCCCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATA > 2:39872/1‑300 AGTAAATGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAANGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAANATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCAAAATGAGCATTC > 2:682760/1‑300 ATCGGTGGAATGGCTGCGTAAGCAGACCGAAGAAGAAGTACTGAATCACCTGTTCGCGAATGAAGATTTCGATCGCTATTACCGCCAGACGCTTTTAGCGGTCAAAAACAATACGCTCTCACCGCGCACCGGCCTGCGGCAGCTCAGTGAATTTATCCAGACGCAATATTTTGATTAAAGGAATTTTTATGTCTTATCAGTATGTTAACGTTGTCACTATCAACAAAGTGGCGGTCATTGAGTTTAACTATGGCCGAAAACTTAATGCCTTAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3063805‑3064082‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCAAAATGAGCATTC < NC_000913/4508679‑4508386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |