Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,342,404 | +TG | coding (484/738 nt) | pyrF → | orotidine‑5'‑phosphate decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,342,400 | 1 | . | T | 96.5% | 290.7 / 3.3 | 87 | coding (480/738 nt) | pyrF | orotidine‑5'‑phosphate decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base T (33/49); total (33/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | NC_000913 | 1,342,400 | 2 | . | G | 96.6% | 313.1 / 2.6 | 88 | coding (480/738 nt) | pyrF | orotidine‑5'‑phosphate decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base G (33/52); total (33/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTTCAACAGCGTGGTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑A‑‑TGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAGTGCATGATGAGTGATTCCAACAGCCGTCTGGTCTACTC > NC_000913/1342101‑1342689 || cTTCAACAGCGTGGTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGNATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACNCaaaa‑‑a > 2:827407/1‑300 (MQ=255) cTTCAACAGCGTGGTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCaaaa‑‑a > 1:25209/1‑300 (MQ=255) gTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑A‑‑tgt‑‑gtggccttga > 1:629568/1‑291 (MQ=255) gTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑A‑‑tgt‑‑gtggcattga > 2:24994/1‑291 (MQ=255) ttttGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAt < 1:993153/300‑1 (MQ=255) ttgtGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAt < 2:490579/297‑1 (MQ=255) tttGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtg < 1:886866/300‑1 (MQ=255) atcccctgcgagatgtgtataagagacagccccAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTNGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtggtgtgg < 2:861443/271‑1 (MQ=255) ctttcttGACCTGACATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtggtgtggtg < 2:960388/300‑1 (MQ=255) ctttcttGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGTTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtggtgtggtg < 2:283943/300‑1 (MQ=255) ctttcttGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGGCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATTACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCTACACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtggtgtggtg < 2:186309/300‑1 (MQ=255) tttcttGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATggtgtggtgt < 1:326415/300‑1 (MQ=255) cggagatgtgtataagagacagatCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGgtgtgt < 1:314026/278‑1 (MQ=255) ttGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTATGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGTGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCAATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTc < 2:275336/300‑1 (MQ=255) ttGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTATGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTc < 1:978891/300‑1 (MQ=255) ttGACCNGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGNAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTc < 2:808012/300‑1 (MQ=255) ctggaaTTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGTTGACTGAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGTTTGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCTTTAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGCGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACGGTCACCTGCAGATTAGGTAGAACGTAGGGCGGCACTGACGCAAAG‑‑GGGTGG‑‑GGCCTTGATGgggtggtgtgggctgagt < 1:431600/296‑9 (MQ=255) cTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTc < 1:870798/300‑1 (MQ=255) aTTCCACGATATCCCCAACACTACAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTATGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTTAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGaa < 2:637034/300‑1 (MQ=255) aTTCCACAATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGaa < 1:391339/300‑1 (MQ=255) atCCCCAACACTGCCGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTATGGTGGGGCGCGTATGATGAACGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCAACTGCAGATTATGCAGAACGTATGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCATTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCt > 1:949073/1‑300 (MQ=255) atCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGgtgtgtctgtctattatacacatctcgc > 2:311626/1‑278 (MQ=255) atCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCt > 1:344994/1‑300 (MQ=255) atCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGAACAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCCGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCt > 1:929652/1‑300 (MQ=255) ccccAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGAtggtgtggctgtctcttatacacatctccgagcccac > 1:883672/1‑271 (MQ=255) caccAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCttt > 1:497594/3‑300 (MQ=255) cAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTaaa > 1:984961/1‑300 (MQ=255) acacTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACa > 1:566282/1‑300 (MQ=255) 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gTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGNCCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTNAACTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAgg > 2:682816/1‑300 (MQ=255) gTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAgg < 1:617278/300‑1 (MQ=255) gTGAAGGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGTTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTTGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAgg < 2:77320/300‑1 (MQ=255) 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aCGCAAAA‑‑ATGTGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTNGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAGTGCATGNTGAGTGATTCCAACAGCCGTCTGGTCTACTc < 2:717549/300‑1 (MQ=255) || CTTCAACAGCGTGGTTTTGATATCTTTCTTGACCTGAAATTCCACGATATCCCCAACACTGCAGCGCACGCTGTCGCTGCTGCAGCTGACTTAGGCGTGTGGATGGTGAATGTTCATGCCTCTGGTGGGGCGCGTATGATGACCGCAGCGCGTGAGGCACTGGTTCCGTTTGGCAAAGATGCACCGCTTTTGATTGCTGTGACAGTGTTGACCAGCATGGAAGCCAGCGACCTGGTCGATCTTGGCATGACACTGTCACCTGCAGATTATGCAGAACGTCTGGCGGCACTGACGCAAAA‑‑A‑‑TGT‑‑GGCCTTGATGGTGTGGTGTGTTCTGCTCAGGAAGCTGTGCGCTTTAAACAGGTATTCGGTCAGGAGTTCAAACTGGTTACGCCGGGCATTCGTCCGCAGGGGAGTGAAGCTGGTGACCAGCGCCGCATTATGACGCCAGAACAGGCGTTGTCGGCTGGTGTTGATTATATGGTGATTGGTCGCCCGGTAACGCAATCGGTAGATCCAGCGCAGACGCTGAAAGCGATCAACGCCTCTTTACAGCGGAGTGCATGATGAGTGATTCCAACAGCCGTCTGGTCTACTC > NC_000913/1342101‑1342689 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |