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cGTTGTTCGATGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑AACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGTTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATa < 2:642503/300‑1 (MQ=255) tgttCGATGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑AACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGc < 1:306352/300‑1 (MQ=255) gttCGATGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑AACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGCa > 2:137433/1‑300 (MQ=255) tCGATGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑AACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGCAAc > 1:891976/1‑300 (MQ=255) aTGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑AACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGCAACCGc > 1:477035/1‑300 (MQ=255) cgaaaa‑a‑a‑CAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAACAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACATACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGCAACCGCTGCGGAGAAGGTc > 2:8722/4‑300 (MQ=255) | GCATTAAAGTGTATTTTATCTGATTGCAAAAACTGCTGAATTTCCTTATCAACAATAGGAGATATCCGATCATTCAGCATAGCAACGCGTGACGGTAAAATATCTAATGCCACAACCTCATGATTTTGTGCGATTAGAAGCCCGTTTGACAAGCCTACATAGCCAGTACCGGAAATGGTGATTTTCATTTCATGCTCTCAGAATTAACTTAACTGTGAATCATGATGTTTTTAGCATCCTGATAAGAGCTAAAAGTTTTAACGCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACG‑AAA‑A‑A‑CAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAATAGGCAACCGCTGCGGAGAAGGTC > NC_000913/2099426‑2100012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |