| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,501,192 | C→T | P207L (CCT→CTT) | tehA → | tellurite resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,501,192 | 0 | C | T | 99.0% | 361.8 / NA | 96 | P207L (CCT→CTT) | tehA | tellurite resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (63/32); total (63/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCAATACTGCTCATCCG > NC_000913/1500911‑1501483 | cGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAg < 2:225429/300‑1 (MQ=255) ttCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTACGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACGTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGGGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGGCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCGTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCt < 2:75793/300‑1 (MQ=255) cAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGNTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCNGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAGGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACCTCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTgg > 2:557342/1‑300 (MQ=255) ggCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAg > 1:237114/1‑300 (MQ=255) ggCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCAATCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAg > 2:232985/1‑300 (MQ=255) ggCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGNTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAg > 2:194336/1‑300 (MQ=255) accgccNGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCNCGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATTGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAAc < 2:698447/299‑1 (MQ=255) gATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTNCACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGc < 2:734994/300‑1 (MQ=255) gATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCAATCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGc > 2:60175/1‑300 (MQ=255) aTCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCt > 2:638282/1‑300 (MQ=255) 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aCGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCNGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGNACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCaa < 2:555577/300‑1 (MQ=255) cGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTAGCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACNGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAAc > 2:619801/1‑300 (MQ=255) cGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAAc > 2:515186/1‑300 (MQ=255) cGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAAc > 1:182381/1‑300 (MQ=255) cTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAActgc < 1:324572/300‑1 (MQ=255) ggACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAActgctg > 1:385419/1‑300 (MQ=255) 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ccGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGt < 1:202146/300‑1 (MQ=255) ccGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCGACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGTGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGTTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGTGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCTGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGt < 1:203167/300‑1 (MQ=255) cAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCNTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGNCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACCGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGAAACTGCTGTTTATGCTAAGTCTGa > 2:591564/1‑300 (MQ=255) 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CGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCAATACTGCTCATCCG > NC_000913/1500911‑1501483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |