| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,315,384 | G→A | Y129Y (TAC→TAT) | yciF ← | DUF892 domain‑containing protein YciF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 1,315,384 | 0 | G | A | 99.4% | 562.4 / NA | 154 | Y129Y (TAC→TAT) | yciF | DUF892 domain‑containing protein YciF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (72/81); minor base C (1/0); total (73/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTG > NC_000913/1315089‑1315676 | gATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGATAAc > 2:517470/1‑300 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ctgctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGctc < 1:408829/300‑1 (MQ=255) gctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCtt > 1:70487/1‑300 (MQ=255) ctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTg > 1:343422/1‑300 (MQ=255) | GATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTG > NC_000913/1315089‑1315676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |