| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 771,305 | A→G | intergenic (+694/‑153) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome bd‑I subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 771,305 | 0 | A | G | 99.3% | 574.7 / NA | 152 | intergenic (+694/‑153) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome bd‑I subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (59/92); minor base T (0/1); total (59/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATT > NC_000913/771012‑771598 | ccAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTGTTAACa < 1:266878/300‑1 (MQ=255) 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CCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATT > NC_000913/771012‑771598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |