| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,215,347 | T→A | intergenic (+138/‑131) | metA → / → aceB | homoserine O‑succinyltransferase/malate synthase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,215,347 | 0 | T | A | 99.2% | 462.5 / NA | 133 | intergenic (+138/‑131) | metA/aceB | homoserine O‑succinyltransferase/malate synthase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (62/70); minor base G (0/1); total (62/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATCAACAAGTTATCAAGTATTTTTAATTAAAATGGAAATTGTTTTTGATTTTGCATTTTAAATGAGTAGTCTTAGTTGTGCTGAACGAAAAGAGCACAACGATCCTTCGTTCACAGTGGGGAAGTTTTCGGATCCATGACGAGGAGCTGCACGATGACTGAACAGGCAACAACAACCGATGAACTGGCTTTCACAAGGCCGTATGGCGAGCAGGAGAAGCAAATTCTTACTGCCGAAGCGGTAGAATTTCTGACTGAGCTGGTGACGCATTTTACGCCACAACGCAATAAACTTCTGGCAGCGCGCATTCAGCAGC > NC_000913/4215051‑4215640 | gATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATCAACAAGTTATCAAGTATTTataa > 1:430823/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |