New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 2690297 | 90 (0.850) | coding (802/1428 nt) | glrK | histidine kinase GlrK | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTCATCAGCAGCATTGGCTCCGCCAGGCAAGCTGTTGCTTTGAGATCGACGTCGGTATGCATCATTTTAGCCCGTGCGGGCAGGCTATGAGCAGAAACCACTGTCTCCACCAGCGGTGCTAACTCAACATTCTCCAGTTCCACCGCACTGTCCGCCTGTTTACGGTTGTAATCAAGCAGTTGTTCGATCAGTTTTTGCAAATTGCGGCTGCTGCTATCAAGAATGCTCACCACCTCTTTTTGCTCTGGCGTAAGCGGCCCGACAACCTGGTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATGAGATAAATGTCTTAAAAATTGATGGCGTTGGGATTCCAGCCATGACAGGCGCTCACTTAACCAAAGAATACGTTGCCCAACCGAGCGTAACTCGCTCGGTCCACTGAACGAGACGCTATTGCCCAGAGAACGCCCTTCCCCCAGACGGTTGATCATGCGCTCGATATTTTTCACCGGCCCGATAATCATCCGCGTGAAAAGCAGTACCATTACCAGACTCACCAGAAATAGCACCAGCGATTGCCAACCAAAATATTGCCCACGTT > NC_000913/2689999‑2690590 | cTCATCAGCAGCATTGGCTCCGCCAGGCAAGCTGTTGCTTTGAGATCGACGTCGGTATGCATCATTTTAGCCCGTGCGGGCAGGCTATGAGCAGAAACCACTGTCTCCACCAGCGGTGCTAACTCAACATTCTCCAGTTCCACCGCACTGTCCGCCTGTTTACGGTTGTAATCAAGCAGTTGTTCGATCAGTTTTTGCAAATTGCGGCTGCTGCTATCAAGAATGCTCACCACCTCTTTTTGCTCTGGCGTAAGCGGCCCGACAACCTGGTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATa > 1:505509/1‑300 (MQ=255) 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agcaTTGGCTCCGCCAGGCAAGCTGTTGCTTTGAGATCGACGTCGGTATGCATCATTTTAGCCCGTGCGGGCAGGCTATGAGCAGAAACCACTGTCTCCACCAGCGGTGCTAACTCAACATTCTCCAGTTCCACCGCACTGTCCGCCTGTTTACGGTTGTAATCAAGCAGTTGTTCGATCAGTTTTTGCAAATTGCGGCTGCTGCTATCAAGAATGCTCACCACCTCTTTTTGCTCTGGCGTAAGCGGCCCGACAACCTGGTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGt < 1:195045/300‑1 (MQ=255) caTTGGCTCCGCCAGTCAAGCTGTTGCTTTGAGATCGACGTCGGTATGCATCATTTTAGCCCGTGCGGGCAGGCTATGAGCAGAAACCACTGTCTCCACCAGCGGTGCTAACTCAACATTCTCCAGTTCCACCGCACTGTCCGCCTGTTTACGGTTGTAATCAAGCAGTTGTTCGATCAGTTTTTGCAAATTGCGGCTGCTGCTATCAAGAATGCTCACCACCTCTTTTTGCTCTGGCGTAAGCGGCCCGACAACCTGGTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTgg < 2:89336/300‑1 (MQ=255) aGCTGTTGCTTTGAGATCGACGTCGGTATGCATCATTTTAGCCCGTGCGGGCAGGCTATGAGCAGAAACCACTGTCTCCACCAGCGGTGCTAACTCAACATTCTCCAGTTCCACCGCACTGTCCGCCTGTTTACGGTTGTAATCAAGCAGTTGTTCGATCAGTTTTTGCAAATTGCGGCTGCTGCTATCAAGAATGCTCACCACCTCTTTTTGCTCTGGCGTAAGCGGCCCGACAACCTGGTCAGCCAGTAATTCAGTGCCCTCGCGCATACTCGCCAGTGGCGTTTTTAATTCATgaga > 1:302818/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |