New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 26 (0.250) | 23/598 | 4.0 | 22.0% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 538086 = | 92 (0.870) | coding (454/1455 nt) | ybbW | putative allantoin transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCTGGCAATTATCCTCAGCGCCTTTTTCATTGCCGCGGTAATGGTATTAAACGGTGCTGCGGGCAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAGTTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTAC > NC_000913/537792‑538384 | aTTCTCTGCTTGTTTACCTTTAGGAGTATATTGGCAATTCTTCTCGGCGCCTTTTTCATTGCCGCGGGAAGGGCATTAAACGGTGCTGCTGGCAGTAAATGCGGTGTGCCTTGGGCTATGATCCGGCAGGCAGATTACGGGGTACGTGGTGCACGGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAGTGGTCGCCGTTGTGTGGGTTGGTTTGTAATGTTACGCGAGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGTCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGAGTTCACTCTGTTAggt < 2:292560/300‑2 (MQ=255) aTTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCTGGCAATTATCCTCAGCGCCTTTTTCATTGCCGCGGTAATGGTATTAAACGGTGCTGCGGGCAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGc < 1:807025/300‑1 (MQ=255) ttCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCTGGCAATTATCCTCAGCGCCTTTTTCATTGCCGCGGTAATGGTATTAAACGGTGCTGCGGGCAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGcc < 1:271158/300‑1 (MQ=255) acctcagctggtatacacttagcagtaggCTGGCAATTATCCCCATCTACATTTTCATTGCCGCGGTAATGGTAGTAAACAGCGCTGCGGGCAGTAAATACGGGGTGCTTTTGGCCATGATCCTGCGTGCTCCCTACGGTGTACTTGGTGCACTGCTCCCCTGAGTGTTAAGGGGCGGAATTGCTGCCATAGTTTGGGGGGGGTTGCAAGGTTACGCGGAGTCACTGGTCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGGGGTGATGGCACTCTGTTAggat < 2:230560/272‑3 (MQ=255) 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gTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTAGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAGTTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGCCTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGAGGTGAGCGCATCCGACTTTAc > 2:26182/1‑300 (MQ=255) | ATTCTCGGCTTGTCTACCTTTAGTATTATGCTGGCAATTATCCTCAGCGCCTTTTTCATTGCCGCGGTAATGGTATTAAACGGTGCTGCGGGCAGTAAATACGGTGTGCCTTTTGCCATGATCCTGCGTGCTTCTTACGGTGTACGTGGTGCACTGTTTCCCGGATTATTAAGGGGCGGAATTGCCGCCATCATGTGGTTTGGTTTGCAATGTTACGCGGGGTCACTGGCCTGCTTGATTCTGATTGGCAAAATCTGGCCGGGATTTTTAACTCTCGGTGGTGATTTCACTCTGTTAGGCCTTTCTCTACCGGGCTTAATTACTTTCTTAATCTTCTGGCTGGTCAACGTTGGTATAGGTTTTGGCGGTGGCAAAGTTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCATCCGACTTTAC > NC_000913/537792‑538384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |