| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
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aTCTTACCCAGCAGAGAGCCAAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacat > 1:558701‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTNATAGTTATTGGCTGTTTTGAGAATGTAATCTTCCAACTGCTTATAACTCTTCAGATGCAATAATCCGAGAATCACATGCAATTTATTCATAANTTCGTGGGATCGTTCACGAAGTGCGTCAGCATAGTTGACCAGACCGTCGAGTCGCTGCATCAGTTTACGTACTTCAGTTTTGTCCCTGAAGGTTGAAATGGCACCGATGATAACGCCATTACTGCGCACCGGAACGGTGTTGATCAGTAATAGCCGGTCTTTAATCGTAATctct > 2:611422/1‑300 (MQ=255) ttACCCAGCAGAGAGCCAAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgtttttcggttcaagtccaaacatccg > 2:428664‑M1/1‑19 (MQ=255) gcagAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCTGTTTTGAGAATGTAATCTTCCAACTGCTTATAACTCTTCAGATGCAATAATCCGAGAATCACATGCAATTTATTCATAAATTCGTGGGATCGTTCACGAAGTGCGTCAGCATAGTTGACCAGACCGTCGAGTCGCTGCATCAGTTTACGTACTTCAGTTTTGTCCCTGAAGGTTGAAATGGCACCGATGATAACGCCATTACTGCGCACCGGAACGGTGTTGATCAGTAATAGCCGGTCTTTAATCGTAATCTCTTCGTcgcggc > 1:637164/1‑300 (MQ=255) agCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCTGTTTTGAGAATGTAATCTTCCAACTGCTTATAACTCTTCAGATGCAATAATCCGAGAATCACATGCAATTTATTCATAAATTCGTGGGATCGTTCACGAAGTGCGTCAGCATAGTTGACCAGACCGTCGAGTCGCTGCATCAGTTTACGTACTTCAGTTTTGTCCCTGAAGGTTGAAATGGCACCGATGATAACGCCATTACTGCGCACCGGAACGGTGTTGATCAGTAATAGCCGGTCTTTAATCGTAATCTCTTCGTCGCGGCGCgggg > 1:79177/1‑300 (MQ=255) gCCAATCTCTTCCTGGTAGTTATTGGCTGTTTTGAGAGTGTAATCTTCCAACTGCTTATAACTCTTCAGATGCAATAATCCGATAATCACATGCAATTTATTCATAAATTCGTGGGATCGTTCACGAAGTGCGTCAGCATAGTTGACCAGACCGTCGAGTCGCTGCATCAGTTTACGTACTTCAGTTTTGTCCCTGAAGGTTGAAATGGCACCGATGATAACACCATTACTGCGCACCGGAACGGTGTTGATCAGTAATAGCCGGTCTTTAATCGTAATCTCTTCGTCGCGGCGCGGGGt < 2:71193/300‑1 (MQ=255) | ATTTTATCGGGTGCGATCCCCGGTCCATCATCATTAACTTCACAGTGCAGCCAGCCGTGACGGTAGTGCAATGTTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAGATTTGATCTTACCCAGCAGAGAGCCAATCTCTTCCTGATAGTTATTGGCTGTTTTGAGAATGTAATCTTCCAACTGCTTATAACTCTTCAGATGCAATAATCCGAGAATCACATGCAATTTATTCATAAATTCGTGGGATCGTTCACGAAGTGCGTCAGCATAGTTGACCAGACCGTCGAGTCGCTGCATCAGTTTACGTACTTCAGTTTTGTCCCTGAAGGTTGAAATGGCACCGATGATAACGCCATTACTGCGCACCGGAACGGTGTTGATCAGTAATAGCCGGTCTTTAATCGTAATCTCTTCGTCGCGGCGCGGGGT > NC_000913/4350209‑4350804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |