New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3720632 = | NA (NA) | 17 (0.160) | 15/598 | 5.8 | NA | intergenic (‑32/‑48) | hokA/insJ | small toxic polypeptide/insertion element IS150 protein InsA |
? | NC_000913 | = 3722077 | NA (NA) | intergenic (+28/+251) | insK/glyS | IS150 family conserved protein InsB/glycine‑‑tRNA ligase subunit beta | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ATAATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAG > NC_000913/3720336‑3720931 | ataatCGATCGCTTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGt < 1:748224/300‑1 (MQ=255) ataatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTTAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGAGTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCAAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGt < 1:145341/300‑1 (MQ=255) ataatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGACACAAATCACTATTAAAAAAAGTAGTCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTATTGCCTTCCAACGAGTAtat > 2:457536/1‑298 (MQ=255) ataatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGt < 1:455090/300‑1 (MQ=255) aatcaatccctgaataaAACCTATTATTATTTTTTTGAAGCAGAAGTTTGGGTGNAATGAAAATGAGCAACGCCGGAGGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCGAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAACCTTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTAc < 2:612179/288‑1 (MQ=255) aatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGNAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTNATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTAc < 2:769524/300‑1 (MQ=255) aatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTTATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTTAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTAc < 2:347263/300‑1 (MQ=255) aatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTAc < 2:25954/300‑1 (MQ=255) atcgCTTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATGTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCAc < 2:458381/300‑1 (MQ=255) atcgCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTGAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCAc < 2:458382/300‑1 (MQ=255) 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gaATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATNTTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATAc > 1:619998/1‑300 (MQ=255) gaATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTCCTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAACAGCCACTAATATGTCAAAGCCAAAATAc > 2:351639/1‑300 (MQ=255) gaATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAACCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATAc < 1:835671/300‑1 (MQ=255) 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gTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAGACATGTAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATc < 2:124969/300‑1 (MQ=255) gTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATc < 1:395822/300‑1 (MQ=255) aTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAg > 2:765642/1‑300 (MQ=255) | ATAATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCAG > NC_000913/3720336‑3720931 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |