| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 889,534 | IS5 (+) +4 bp | coding (283‑286/1686 nt) | ybjL ← | putative transport protein YbjL |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 133 (1.260) | 84/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 889534 = | 0 (0.000) | coding (286/1686 nt) | ybjL | putative transport protein YbjL | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 107 (1.010) | 70/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 889537 | 0 (0.000) | coding (283/1686 nt) | ybjL | putative transport protein YbjL | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC < NC_000913/889537‑889240 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATATAATATCAGGGAATTGTTCGCACCTTACTTAGCACTGGTG > 2:721828/1‑300 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GTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCA > 1:225328/1‑300 GTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACAGGATCTAATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCA > 2:796351/1‑300 GTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGAGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCA > 2:64599/1‑300 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TTCCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGC < 2:244828/300‑1 TTCCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGC > 1:11446/1‑300 CCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC > 2:221082/1‑300 CCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC > 1:350571/1‑300 CCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTAACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC > 2:249009/1‑300 CCTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGACTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACTGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGACAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACGCACAGACCAGCGCCC > 2:136315/1‑300 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC < NC_000913/889537‑889240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |