Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,707,947 | C→A | intergenic (‑242/+669) | dppA ← / ← proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,707,947 | 0 | C | A | 99.2% | 467.1 / NA | 131 | intergenic (‑242/+669) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (86/44); total (86/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGG > NC_000913/3707649‑3708242 | agcaaccaGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGAACTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACCATCTGTCAAAAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTCCACCACCGGTGAGAATCcacaca > 1:351225/5‑300 (MQ=255) 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aTCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCATAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATg > 2:403565/1‑300 (MQ=255) tCCACACACAAATATTAAAAAAACTTCAACCAGCTATGTGCATCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACACGACCAGAACAATCAGCTTAAGAGGTAGCAACAGTTGGTGAGTAGGTTCTATACATTTAATGAAAAAAATCGAAGGAAAAAGTGGAGATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCGAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGCAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTCCTGTCACAAATCCGTGAATGGAGAGTGAGATATgg < 2:348363/300‑1 (MQ=255) cacaaacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTNATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATgggg < 2:683371/300‑1 (MQ=255) | AGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGG > NC_000913/3707649‑3708242 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |