Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,495,107 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑36/‑177) | ydcI ← / → ydcJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator YdcI/DUF1338 domain‑containing protein YdcJ |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 110 (1.120) | 74/596 | 0.1 | 99.1% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | 1495107 = | 1 (0.010) | intergenic (‑36/‑181) | ydcI/ydcJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator YdcI/DUF1338 domain‑containing protein YdcJ |
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TGATGGCGTCAAGAACTCTGACTGCATGCGTTAAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCCTGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCCGCAATATGGCACGCTGCTGGAACTGGTAGCTGATGTGAATCT > NC_000913/1494816‑1495409 | acctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGAAgttg < 1:510230‑M2/9‑1 (MQ=255) 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gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGCATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCCGCa > 1:769342‑M2/37‑300 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTCTGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGCGATCACAGTTTGTAAATTTTTACCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTTCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACCCTATGGCTAACAGCATCCAGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCTCAGGCAATGTCAGCCATATACCAGCAAGAAGTTCCGCAat > 2:157376‑M2/35‑300 (MQ=255) aGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttc > 1:260524‑M2/1‑39 (MQ=255) tgtctgnagattcagggggccagtctaGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGNTTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATGATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCCGCAATATGGCAc < 2:635185‑M2/273‑1 (MQ=255) agattcagggggccagtctaGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGACTGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGCCACTATGGCGAACAGCCTCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACAAGCAAGAAGTTCCGCAATATGGCACGctgctg > 1:86023‑M2/21‑300 (MQ=255) gtgtCGCTGACAAGTGAAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatnccattcgttataatgctcgaacgcctntgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactgtccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgg < 2:515202‑M2/300‑283 (MQ=255) 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TGATGGCGTCAAGAACTCTGACTGCATGCGTTAAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCCTGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCCGCAATATGGCACGCTGCTGGAACTGGTAGCTGATGTGAATCT > NC_000913/1494816‑1495409 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |