| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781222 | 48 (0.490) | 12 (0.160) | 11/446 | 4.9 | 20.7% | noncoding (76/76 nt) | lysY | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781653 = | 56 (0.760) | intergenic (+1/‑432) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGG > NC_000913/780930‑781507 | gAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGCCCAACCACTAATGACGATGGGCTCAGTAGACATCGTTTGTAGTCTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGCGCACCTCCCTTACCAGGAGGGAGTCGGTGGTTCGATCACGTCATCACCCACCACTCGGGTTGTTAGTTCCGTTGGTCGAGCAGTTGAATTTTAATCAATTGGTTGCAGGTTTGAATCCTGCACGAACCACCAGttttca > 2:211094/1‑298 (MQ=25) gACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGTTTCGGTGGAAGTAGTTTTTAGTATCCAGCGCAGTAGCGGGTGAGTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACACGTAGGGGGGCGGCGGTGCGATCCAGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAt < 2:279767/300‑1 (MQ=25) tGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACt > 1:643142/1‑300 (MQ=255) gtgtAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCATGACGGTTGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCCGCTGGGAGAGTACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTCCGATCCCGTCATCAACCACCACTAGGGTCGTTCGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTCAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCAACCAGTTTTAACATCACGCTCAGGTGtt > 2:88100/1‑300 (MQ=255) ggATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCCCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGGGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAAGACCCACCAATTTTAACACCCAACCCAGATGTTAAGCg > 2:545/1‑300 (MQ=255) ggATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAtttcaaagtggccatcggtagagaaaat > 1:656730/1‑275 (MQ=255) tCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGt < 1:60119/300‑1 (MQ=255) 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cAATTGGTCGCAGGGTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGTTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:105432/300‑1 (MQ=255) ggTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACNCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGCGTAAACATCTTTCAG‑GTCACACCCGCATATGTCGTTNGCCCCTTTGTTAGAGCAGTCGCCTCCTCATCAATTGGTAGTCGGTTCTCATCCTGCACAACCCAGCACTTTCCAGGTGGTTATTGGTAGAGACCGTGCAGGCTAACTTTGCGt > 2:620961/1‑300 (MQ=9) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAGACATCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGGGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAACAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGGTAACGTTGAGTTAGCACCgg > 1:667953/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTAAAAGATTGGCCCAGAGTAGCCCTCTTTCGG‑TTCAAACCCGCCTGGGTCGTCAGTTCAGTTGGGAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTAATAGAAGGTTCAAACCCTGCACGACCCAACAATCTAGAAGTGGTCAATGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGTGCTAGAAACGGcaaga > 1:348976/1‑296 (MQ=16) ccTGCACGACCCACCTGTTTTAACATCAACCGCAAACGGTAAGCGTGGCGGATAACGTTGCGTCAGCAACTACCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCNATCTTAAAGATTGGTCCCGAGTGAAAATCTTTCAC‑GTAACACCCGTGTGGGTCGTTAGCTCNGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAg < 2:627059/300‑1 (MQ=37) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGCAGAGAACGTGCAGGATAGCGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg > 2:257548/1‑300 (MQ=255) | GAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAG‑GTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGG > NC_000913/780930‑781507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |