Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 303,716 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+111/+133) | yagU → / ← ykgJ | DUF1440 domain‑containing inner membrane protein YagU/putative metal‑chelating domain‑containing protein YkgJ |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 303720 | 2 (0.020) | 120 (1.220) | 85/598 | 0.0 | 98.3% | intergenic (+115/+133) | yagU/ykgJ | DUF1440 domain‑containing inner membrane protein YagU/putative metal‑chelating domain‑containing protein YkgJ |
? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
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GTTCATATGATTTCATTCCCTCTCATGGGACTGACGCCACCTCTGTTTGATCTCCCGTGGTATGAGAATGTTTCTGAAATTTTTGGACATTTAGTCTGGTTCTGGTCTATTGAAATTATTCGCAGAGATTTACGAAACAGAATTACTCATGAGCCAGACCCTGAGATCCCTTTAGGCTCAAACAGATAATGCATTGAATGATAAAAATGGCGCAAATACAGCGCCATTTTTATAGGTTAAAAACATTGCTTTTTATATTCTGATGCAGATAGTCAGTGAGTATATCGCGCTACTTCAGGATGATGTAGATCCGAAGAACGCTACAGAAGAGAGGCATTGTTGCTGGCAAATAGAAGAAGTATCGGGTTTTGTTACCCCTGAAAAACGAAGCCCCGCTATTATCGCTGGCGGGGCAGTGCAATTAATTATTGTATGTTTATAACGGTGTCAGCCCGTATTTAGCCCTTGCACGATTGCAAGCCTCATTGACGACTCCGTTCTCACCAGACATGGCGAATTCTCTGCATGTGGACGATCGATTTTTATATATCGTGCAGCAGGCATTTTTGCCCGGGGTTCCTGCAAGGGCAATACATCGG > NC_000913/303417‑304015 | gTTCATATGATTTCATTCCCTCTCATTGGACTGACGCCACCTCTGTTTGATCTCCCGTGGTATGAGAATGTTTCTGAAATTTTTGGACATTTAGTCTGGTTCTGGTCTATTGAAATTATTCGCAGAGATTTACGAAACAGAATTACTCATGAGCCAGACCCTGAGATCCCTTTAGGCTCAAACAGATAATGCATTGAATGATAAAAATGGCGCAAATACAGCGCCATTTTTATAGGTTAAAAACATTGCTTTTTATATTCTGATGCAGATAGTCAGTGAGTATATCGCGCTACTTCAGga < 2:352785/300‑1 (MQ=255) 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GTTCATATGATTTCATTCCCTCTCATGGGACTGACGCCACCTCTGTTTGATCTCCCGTGGTATGAGAATGTTTCTGAAATTTTTGGACATTTAGTCTGGTTCTGGTCTATTGAAATTATTCGCAGAGATTTACGAAACAGAATTACTCATGAGCCAGACCCTGAGATCCCTTTAGGCTCAAACAGATAATGCATTGAATGATAAAAATGGCGCAAATACAGCGCCATTTTTATAGGTTAAAAACATTGCTTTTTATATTCTGATGCAGATAGTCAGTGAGTATATCGCGCTACTTCAGGATGATGTAGATCCGAAGAACGCTACAGAAGAGAGGCATTGTTGCTGGCAAATAGAAGAAGTATCGGGTTTTGTTACCCCTGAAAAACGAAGCCCCGCTATTATCGCTGGCGGGGCAGTGCAATTAATTATTGTATGTTTATAACGGTGTCAGCCCGTATTTAGCCCTTGCACGATTGCAAGCCTCATTGACGACTCCGTTCTCACCAGACATGGCGAATTCTCTGCATGTGGACGATCGATTTTTATATATCGTGCAGCAGGCATTTTTGCCCGGGGTTCCTGCAAGGGCAATACATCGG > NC_000913/303417‑304015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |