| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,301,713 | IS30 (–) +2 bp | coding (532‑533/1632 nt) | oppA → | oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1301714 | 0 (0.000) | 153 (1.390) | 90/596 | 0.0 | 100% | coding (533/1632 nt) | oppA | oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
AAAATCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAATTCAGAATTTAGGTTTTGCTTTTGTTACTGGTGAAAATACAACAGGTATAAATAGTGGCACGATCTCGTTATTACAAAATGGTAAAGATCCGGCACCGTCTCCCATTGTTTTACTGGCTACTAACGGAGGGAGCGCCACTAATGCAGGTACGATCACAGGTAAAGTGACGGAACAACATAGCGTATTTAACAAGTATTCAACGGGCACATCGAATTCATTTATTTTTAATAACGATGTCAGTAGCATAACAGGGTTAGTCGCTCAATCGAATAGCACAATTATCAATAC > NC_000913/1470218‑1470814 | aaaaTCACTGACATGGGGCAGAGGAATGGAACTTGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTCTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTCCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTTAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTacac < 2:150848/300‑1 (MQ=2)aaaaTCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTacac < 1:174441/300‑1 (MQ=11)aaaaTCACTGACATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCGAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTacac < 1:718246/300‑1 (MQ=11) aCATGGGACAGAGGAATGGAACTGGCCAGACATCTAGAATTTACTGTCAGCACCGGCGTTAAAGTTTACTTCTGCGATCCTCAGAGTCCTTGGCAGCGGGGAACAAATGAGAACACAAATGGGCTAATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGTTGAAAtt > 1:709851/1‑300 (MQ=33) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |