New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 791973 | 115 (1.050) | coding (83/1017 nt) | galE | UDP‑glucose 4‑epimerase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCC > NC_000913/791675‑792270 | aacgtttgcgtgggggCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTGGCGGCGCGCATGGCGCTAATCGGGCGCAGAGTGCCGTTTACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACACTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAatgat < 2:49439/285‑1 (MQ=255) gTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGAca > 2:174368/1‑300 (MQ=255) ggCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGAcatc > 1:762354/1‑300 (MQ=255) gggagCTGAAAATAAAGTTTTTTACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGAc < 2:38673/299‑1 (MQ=255) 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agGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATTTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTTTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGt < 1:780289/300‑1 (MQ=255) ggTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTc > 1:283998/1‑300 (MQ=255) tgatgaCATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGcc < 1:559543/300‑1 (MQ=255) | AACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGACGCGGTTTCATGCCTGCATGCGTCGAACCGTTGGCC > NC_000913/791675‑792270 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |