| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 430,095 | 2 bp→AT | coding (591‑592/972 nt) | secF → | Sec translocon accessory complex subunit SecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 430,095 | 0 | G | A | 98.8% | 294.2 / NA | 82 | L197L (CTG→CTA) | secF | Sec translocon accessory complex subunit SecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (36/44); minor base C (1/0); total (37/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 430,096 | 0 | A | T | 100.0% | 294.6 / NA | 82 | T198S (ACC→TCC) | secF | Sec translocon accessory complex subunit SecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (37/45); total (37/45) | |||||||||||
TGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTGACCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGCTGCACCGTACCTTGATCACATCCGGTACTACCTTGATGGTTATCCTGATGCTGTACCTCTTCGGTGGTCCGGTACTGGAAGGCTTCTCGCTGACCATGCTTATCGGTGTTTCCATCGGTACTGCATCTTCCATCTATGTGGCATCTGCGT > NC_000913/429804‑430387 || tgctgAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGGCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATtgt < 1:583245/300‑1 (MQ=255) aCCGGCGGTCAGGTGGTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTTGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATg < 1:415499/300‑1 (MQ=255) ggTGTTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGtcggttatcgg > 1:242473/1‑300 (MQ=255) gtgtTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGtcggttatcggt > 2:751530/1‑300 (MQ=255) gtgtTGGGCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGtcggttatcggt > 1:284806/1‑300 (MQ=255) gggCAGCCAGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGNGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGAATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTc > 2:191169/1‑300 (MQ=255) aGGTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACg > 1:426881/1‑300 (MQ=255) gTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGAc < 1:297148/300‑1 (MQ=255) gAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTAt < 1:18236/300‑1 (MQ=255) gAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTAt < 2:432889/300‑1 (MQ=255) aGGTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCg < 1:258749/300‑1 (MQ=255) ggTGATTAACGAATCCACCAATCAGAATGCATCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGt < 2:399865/300‑1 (MQ=255) gAATCCACCAATCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGAc < 2:419126/300‑1 (MQ=255) aTCAGAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTg < 2:422204/300‑1 (MQ=255) gAATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGaaaa > 1:382904/1‑300 (MQ=255) aTGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACt > 2:478707/1‑300 (MQ=255) cagcagTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTANTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTcc > 2:682064/1‑300 (MQ=255) aagtgtagtGAGTTTGTCGGGCAGAGCGTGGGGGTAGACCTTGCGCAAGCCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGATTGGCGACTGGCGGCAGGGGGGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACGTCCGCAAGATc < 2:125072/292‑1 (MQ=255) aGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATcc > 2:25612/1‑300 (MQ=255) gcgTTCGTCGGTCCGAGTGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATNTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGt > 2:186534/3‑300 (MQ=255) tcgtcgGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGc < 1:187337/300‑1 (MQ=255) ggTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACAGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTAAGATGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCAATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTACGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTAc > 1:180445/1‑300 (MQ=255) gTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGCGATTGCCCTCTCCATTGTGGCATCGTTGCTGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTCTTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCCTACg > 1:375602/1‑300 (MQ=255) gTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACg > 1:2810/1‑300 (MQ=255) aGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATc > 1:176440/1‑300 (MQ=255) ggggCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAAc > 2:147163/1‑300 (MQ=255) gggCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACg > 1:421155/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCCCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTGGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCt < 2:158242/300‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCtt > 2:350603/1‑300 (MQ=255) cgcAAACCTGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGAccc < 2:362445/300‑1 (MQ=255) cgcAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGAccc < 1:746587/300‑1 (MQ=255) aaCCGGGGCGATGGCGTTGATTGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGNTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGTCGGCACGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGAc < 2:584489/300‑1 (MQ=255) ccGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGc < 1:334609/300‑1 (MQ=255) ccGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGAACCAGACGc > 2:226713/1‑300 (MQ=255) 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gCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACTTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGCTGCACCGTAcc < 2:367050/300‑1 (MQ=255) cGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCNATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATNGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGCTGCACCGTACCt < 2:524561/300‑1 (MQ=255) cGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCGCTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCATATCGAGATTGACCTATCCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAACTTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGCTGCACCGTACCt < 1:370152/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |