| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,188,716 | T→C | pseudogene (1285/2434 nt) | yqiG → | putative outer membrane usher protein YqiG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,188,716 | 0 | T | C | 99.3% | 574.2 / NA | 152 | pseudogene (1285/2434 nt) | yqiG | putative outer membrane usher protein YqiG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (92/59); total (92/60) | |||||||||||
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Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
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cAAAATGTTTCGAATCGACCGGGAGCCAGCTCACTTTCGCTGGTTACCGTTTCTCTGATAAAAACTTTGTGACAATGAATGAATATATCAATGACACTAACCATTACACGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTCGTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTCCACTTCTCTAACAt < 1:100642/300‑1 (MQ=255) cAAAACGTTTCGAATCTACCGGTAGCCAGCTCACTTTCGCTGGTTACCGTTTCTCTGATAAAAACTTTGTGACAATGAATGAATATATCAATGACACTAACCATTACACGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTCGTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTCCACTTCTCTAACAt < 1:508976/300‑1 (MQ=255) gTTTCGAATCTACCGGTAGCCAGCTCACTTTCGCTGGTTACCGTTTCTCTGATAAAAACTTTGTGACAATGAATGAATATATCAATGACACTAACCATTACACGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTCGTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCAATTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTACACTTCTATAACATTTAGcc > 1:678424/1‑300 (MQ=255) | GATTCGCTACACCACTGCTATGGGTAAACCGACCAGCGTTGGTGGTGATTCCTTACAACAACCCTTCTTCTGGACTGGTGAATTCTCATGGGGTTGGCTGAACAATGTATCCCTGTATGGTGGTTCAGTTTTAACAAACCGTGATTATCAATCTCTGGCTGCCGGCGTTGGTTTTAATCTTAACTCATTAGGTTCATTATCTTTTGATGTCACACGATCTGATGCTCAGTTGCATAATCAGGATAAAGAAACGGGTTATAGCTACCGCGCTAACTATTCAAAACGTTTTGAATCTACCGGTAGCCAGCTCACTTTCGCTGGTTACCGTTTCTCTGATAAAAACTTTGTGACAATGAATGAATATATCAATGACACTAACCATTACACGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTCGTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTCCACTTCTCTAACATTTAGCC > NC_000913/3188428‑3189011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |