New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 184226 = | 99 (1.020) | 5 (0.050) | 5/596 | 8.8 | 4.8% | intergenic (‑131/+31) | yaeH/yaeI | DUF3461 domain‑containing protein YaeH/phosphodiesterase YaeI |
? | NC_000913 | 270541 = | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAGAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCAAAATGA > NC_000913/270243‑270828 | tGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTg < 1:242184/300‑1 (MQ=255) gATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTAAAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGt > 1:474494/1‑300 (MQ=255) atGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGAAGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAGTATTAAAAAAGGCTACTGTAGa > 2:24735/1‑300 (MQ=255) tGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGAt < 1:690482/300‑1 (MQ=255) gCTCACCTAAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTACCACATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAgcgt > 2:415906/1‑297 (MQ=255) aCCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAt < 1:684492/300‑1 (MQ=255) cctaaGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAAAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCACCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt > 2:586845/5‑300 (MQ=255) 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cagccagcGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCAGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAAc > 1:640478/1‑300 (MQ=255) gcgcTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGCACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACa > 2:735461/1‑300 (MQ=255) gcgcTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACa > 2:696888/1‑300 (MQ=255) 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gAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGc < 1:678827/300‑1 (MQ=38) atatTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCATCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCaa > 2:409203/1‑300 (MQ=17) atTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCaaaa > 1:721277/1‑300 (MQ=32) | TGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAGAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAACTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGGCAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACACTGTCTGAGCGCGAGGAGATACGAGCTGGTTTGTCAGCCAAAATGA > NC_000913/270243‑270828 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |