Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,590,490 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑489/+360) | ydeT ← / ← hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 106 (1.080) | 72/598 | 0.1 | 99.1% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | 1590490 = | 1 (0.010) | intergenic (‑489/+364) | ydeT/hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 111 (1.140) | 75/596 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1590494 | 0 (0.000) | intergenic (‑493/+360) | ydeT/hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1468944‑1469240 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCACAGCAGCCTATGCTGTCGGTTACGAAAGCTATCCCATTTCAGTCGGGAATATTCGCGGATGTTTGGAGAGTCACCCAAGAGAGATATTACCAGGTTAAGAAAGTCTGTCGGACAGCTTTAATAAACCCTGCACTTATCTGTTTAGAGCAATTCGGTGTTAGTTTCAGCAAGCAAACATTAACCATAGCTAATGATTTATAGCCATATTAACCATTGGTAGCTCTTGACCTTTCCTGACACTTCCCTTGTTCGCAA < NC_000913/1590494‑1590200 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCCCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTC > 2:136572/1‑300 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CAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACG > 1:462802/1‑300 GTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATGACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACGATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGGACGCCGTCTGCNTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCANCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGGATGAACATTATGAT < 2:517856/300‑1 TCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCAC < 1:431328/300‑1 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GTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCACAGCAGCCTATGCTGTCGGTTACGAAAGCTATCCCATTTCAGTCGGGAATATTCGCGGATGTTTGGAGAGTCACCCAAGAGAGATATTACCAGGTTAAGAAAGTCTGTCGGACAGCTTTAATAAACCCTGCACTTATCTGTTTAGAGCAATTCGGTGTTAGTTTCAGCAAGCAAACATTAACCATAGCTAATGATCTATAGCCATATTAACCATTAGTAGCTCTTGACCctgtctcttatacatatctcaccgag > 2:274202/1‑274 GTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCACAGCAGCCTATGCTGTCGGTTACGAAAGCTATCCCATTTCAGTCGGGAATATTCGCGGATGTTTGGAGAGTCACCCAAGAGAGATATTAACAGGTTAAGAAAGTCTGTCGGACAGCTTTAATAAACCCTGCACTTATCTGTTTAGAGCAATTCGGTGTTAGTTTCAGCAAGCAAACATTAACCATAGCTAATGATTTATAGCCATATTAACCATTGGTAGCTCTTGACCTTTCCTGACACTTCCCCTGTTCGCAc > 2:195650/1‑299 GTCTAGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCACAGCAGCCTATGCTGTCGGTTACGAAAGCTATCCCATTTAAGTCGGGAATATTCGCGGATGTTTGGAGAGTCACCCAAGAGAGATATTACCAGGTTAAGAAAGTCTGTCGGACAGCTTTAATAAACCCTGCACTTATCTGTCTAGAGCAATTCGGTGTTAGTTTCAGCAAGCAAACATTAACCATAGCTAATGATTTATAGCCATATTAACCATTGGTAGCTCTTGACCctgtctcttctacacatctcgcaggg > 2:273888/1‑274 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1468944‑1469240 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGTCAGGCGACAGATGCTGAATGAACATTACGATGTCACCACAGCAGCCTATGCTGTCGGTTACGAAAGCTATCCCATTTCAGTCGGGAATATTCGCGGATGTTTGGAGAGTCACCCAAGAGAGATATTACCAGGTTAAGAAAGTCTGTCGGACAGCTTTAATAAACCCTGCACTTATCTGTTTAGAGCAATTCGGTGTTAGTTTCAGCAAGCAAACATTAACCATAGCTAATGATTTATAGCCATATTAACCATTGGTAGCTCTTGACCTTTCCTGACACTTCCCTTGTTCGCAA < NC_000913/1590494‑1590200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |