Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,934,134 | 0 | A | C | 99.1% | 425.0 / NA | 109 | intergenic (‑446/‑101) | fucA/fucP | L‑fuculose‑phosphate aldolase/L‑fucose:H(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (40/68); total (41/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACA‑GGCAAATATTCACTGATATGAAGCCCGAACTCGCTGGTTTTGCACTTTTGAAAACATAACCGATTACGTGCTTAAGCTTCTGAACCTAAGAGGATGCTATGGGAAACACATCAATACAAACGCAGAGTTACCGTGCGGTAGATAAAGATGCAGGGCAAAGCAGAAGTTACATTATTCCATTCGCGCTGCTGTGCTCACTGTTTTTTCTTTGGGCGGTAGCCAATAACCTTAACGACATTTTATTACCTCAATTCCAGCAGGCTTTTACGCTGACAAATTTCCAGGCTGGCC > NC_000913/2933838‑2934427 | gTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTNATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTNAGCCA‑g > 2:752084/1‑300 (MQ=255) 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cATTTCAGCCA‑GGCAAATATTCACTGATATGAAGCCCGAACTCGCTGGTTTTGCACTTTTGAAAACATAACCGATTACGTGCTTAAGCTTCTGAACCTAAGAGGATGCTATGGGAAACACATCAATACAAACGCAGAGTTACCGTGCGGTAGATAAAGATGCAGGGCAAAGCAGAAGTTACATTATTCCATTCGCGCTGCTGTGCTCACTGTTTTTTCTTTGGGCGGTAGCCAATAACCTTAACGACATTTTATTACCTCAATTCCAGCAGGCTTTTACGCTGACAAATTTCCAGGCTgg > 2:858783/1‑300 (MQ=255) tttCAGCCA‑GGCAAATATTCACTGATATGAAGCCCGAACTCGCTGGTTTTGCACTTTTGAAAACATAACCGATTACGTGCTTCAGCTTCTGAACCTAAGAGGATGCTATGGGAAACACATCAATACAAACGCAGAGTTACCGTGCGGTAGATAAAGATGCAGGGCAAAGCAGAAGTTACATTATTCCATTCGCGCTGCTGTGCTCACTGTTTTTTCTTTGGGCGGTAGCCAATAACCTTAACGACATTTTATTACCTCAATTCCAGCAGGCTTTTACGCTGACAAATTTCCAGGCTGGcc < 2:553036/300‑1 (MQ=255) tttCAGCCA‑GGCAAATATTCACTGATATGAAGCCCGAACTCGCTGGTTTTGCACTTTTGAAAACATAACCGATTACGTGCTTAAGCTTCTGAACCTAAGAGGATGCTATGGGAAACACATCAATACAAACGCAGAGTTACCGTGCGGTAGATAAAGATGCAGGGCAAAGCAGAAGTTACATTATTCCATTCGCGCTGCTGTGCTCACTGTTTTTTCTTTGGGCGGTAGCCAATAACCTTAACGACATTTTATTACCTCAATTCCAGCAGGCTTTTACGCTGACAAATTTCCAGGCTGGcc > 1:737241/1‑300 (MQ=255) | GTAAATAACTGCAAGTTCTCTTTTTATAACCCCATTAAAAATGACCGCTCTTAAAAATATTTATCAAAACGGTCATTTTTCTATTCCTCCAAGCCCGGAATGACCGTTTTCGGCACAAACAATTAATACGGTCATCTGATTTGTGTTTTTTATGATTTATTTTCTGAAACGGGCATGAAATTTCGATTATTAAAGTGATGGTAGTCACATAAAGTCACCTTCTAGCTAATAAGTGTGACCGCCGTCATATTACAGAGCGTTTTTTATTTGAAAATGAATCCATGAGTTCATTTCAGACA‑GGCAAATATTCACTGATATGAAGCCCGAACTCGCTGGTTTTGCACTTTTGAAAACATAACCGATTACGTGCTTAAGCTTCTGAACCTAAGAGGATGCTATGGGAAACACATCAATACAAACGCAGAGTTACCGTGCGGTAGATAAAGATGCAGGGCAAAGCAGAAGTTACATTATTCCATTCGCGCTGCTGTGCTCACTGTTTTTTCTTTGGGCGGTAGCCAATAACCTTAACGACATTTTATTACCTCAATTCCAGCAGGCTTTTACGCTGACAAATTTCCAGGCTGGCC > NC_000913/2933838‑2934427 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |