Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 3,639,755 | IS150 (+) +3 bp | intergenic (‑35/‑354) | uspB ← / → uspA | universal stress protein B/universal stress protein A |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3639757 | 1 (0.010) | 144 (1.280) | 81/598 | 0.1 | 99.3% | intergenic (‑37/‑354) | uspB/uspA | universal stress protein B/universal stress protein A |
? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCG > NC_000913/3721777‑3722370 | cGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACaa > 1:122061/1‑300 (MQ=255) 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ccgTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTATGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTCTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATANTCTTTATTCAGCAGAAGATTCTTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAGAAAAGCCTGCAAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGACACAGCGAAACATCCGCAATGCGCAGGAATAGtt > 2:225493/3‑300 (MQ=255) gTACAccccggggctaccgctcccgatacgctgcccatcagttaacaccaggtcctggagaaaccgcttttgtggtgaccaacatacgagcggctctatagatagtgtaggagatcaggttgttttttttccagaaggttaaccactatcaatatattcatgtcgaaaatttgtttatctaacgagtaagcaaggcggattgacggatcatccgggtagctataaggtaaggatggtcttaacactgaatctttacggttgggttagccccgcgcacgtagttcgcaggacgcgggtgac < 2:442662‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTANAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTcg > 1:661759/1‑300 (MQ=255) | CGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCG > NC_000913/3721777‑3722370 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |