New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | 35 (0.310) | 32/598 | 2.9 | 21.3% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1555644 | 129 (1.150) | coding (26/1698 nt) | maeA | malate dehydrogenase (oxaloacetate‑decarboxylating) |
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GTTGGGGTATAAATAACAGGCATCATCTCATCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGAC > NC_000913/1555350‑1555941 | ggTATAAATAACATGCATCATCTCAGCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATACAGGAGCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCNGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCANC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGtttttt < 2:654946/300‑1 (MQ=255) aaataaCAGGCATCATCTCATCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTttttt‑gttt > 1:221992/1‑300 (MQ=255) tcatctcatcAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATANTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACtgtagattcaatctgtcaatgcaacac > 1:670889‑M2/1‑273 (MQ=255) gACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCAATCACTCTTTTTTGAATatccatcc > 2:420216/1‑300 (MQ=255) aCGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGNTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGNAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑TTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATccc < 2:628640/300‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACtgtngattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaa < 2:684676‑M2/300‑59 (MQ=255) gTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTgg > 2:325175/1‑300 (MQ=255) 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ataAAGCGAACtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattatctctttcggtgttttgaacttcagtgtctttctcggtctgttgtttagctgagcagcaaccagatctagttcatgttgagtatattgggcaagacatgtctttttaggaaagtactgccgaattagcccatttgtgttctcatttgttccccgctgccaaggactctgaggatcgcagaagtaaactttaacgccggtgctgacagtaaattctagatgtctggccagttccattcctctgtcccatgt > 1:700091‑M2/1‑11 (MQ=255) tctacaaaCGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGaa < 1:800811/294‑1 (MQ=255) gaaGCGAACGCTGTTTTTGT‑GTTTTTGTTTCCATGTCACTCACTCTTCTTTGAATATCCATCCCTTTGGGGCGTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCTGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGaa < 2:880764/299‑1 (MQ=255) aaaGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGaa < 1:425176/300‑1 (MQ=255) gCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCNATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTNATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAatat < 2:622292/300‑1 (MQ=255) aaCGTTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGTGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACANCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGAc < 2:205226/300‑1 (MQ=255) | GTTGGGGTATAAATAACAGGCATCATCTCATCAAGATGATTGTTTACCAGACGGTAGAAGAGGGTTTCGTTAGTGTCCTGGATGTTACGCAGGTAGATGTGTTTGTCGATTTCGGTTTTGAATCCCTGATACTGGATCCATGCTCGTTCCGCTTGTTCTTCGATGGTTTCGACCACTTCCGGCAGTAACCCCAGCAGGTTGAAGTTACGGCGTTCTTCCATGCTGAAGGCACTGCCTTTATTCAACAACGGAAATTCCAGCAGTACAGGGCCAGC‑GTAAGGGATATAAAGCGAACGCTGTTTTTTT‑GTTTTTGGTTCCATGTCACTCACTCTTTTTTGAATATCCATCCCTGGGGGGCTTTTATCGTCTTTGCTTTACCGCCAGGGCGTCGGCCTCAAGTATAAAGCAGATAAAAACAAAAACACCATTGCGCAGGCAATGGTGTTTAATCGTCATTGAGGACTGATGGTTATGAATTACTTTTCAGCGGGGCGTTTTCTGCCGGTTGGGTTATTTACTACGCTGGATTTGTCACCTTCGGTAACTATTTTGCGCTGGTTAGAAATTTTATGGTCCAGTCCAAGAATATGAC > NC_000913/1555350‑1555941 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |