| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3499637 | 109 (0.970) | 24 (0.210) | 22/598 | 4.6 | 18.1% | intergenic (+22/‑273) | yhfL/frlA | DUF4223 domain‑containing lipoprotein YhfL/fructoselysine/psicoselysine transporter |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGC > NC_000913/3499341‑3499933 | gCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTCAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAacac > 1:266337/1‑300 (MQ=255) cTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTCATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTCATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTANGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGNAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACTACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTaatgtagatt < 2:602725/300‑9 (MQ=255) tGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTaatgtagattc < 1:344137/300‑10 (MQ=255) ccAATTCAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTCGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCNTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTNTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTg < 2:634877/300‑1 (MQ=255) aaaTATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGANTATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCNACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTaatgtagattcaattggtcaac > 2:850466/1‑280 (MQ=255) aaaTATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCNACTGCACAGTAAGTCTATGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTNCCCGAc > 2:746997/1‑300 (MQ=255) atatTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGc < 2:514797/300‑1 (MQ=255) atTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGccc < 1:399755/300‑1 (MQ=255) ttCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTANTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTNATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTAACTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCct > 2:603287/1‑300 (MQ=255) ttCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGCACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAACATCATTAGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACAGGTTTAATTGCCCGACGCCct > 1:871553/1‑300 (MQ=255) 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gTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTg > 1:568878/1‑300 (MQ=255) cTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATATGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGNAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGtt < 2:209517/300‑1 (MQ=255) cTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGtt > 2:439566/1‑300 (MQ=255) 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gTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTAt > 1:570019/1‑300 (MQ=255) gcattgacagattgaatctacaaaCACCGGTNTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCNATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAGAAAGGTATCGCTATgg > 2:650949/23‑300 (MQ=255) aGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATNTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTANATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATggg < 2:848176/300‑1 (MQ=255) aGTCTCTGACAGAAATCGACTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATggg < 2:257625/300‑1 (MQ=255) gTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAANTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGa < 2:223444/300‑1 (MQ=255) tctcTAACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTTCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGaa < 2:149620/300‑1 (MQ=255) gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGAAGCCAGGAAc < 1:445190/300‑1 (MQ=255) gCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACg > 2:351876/1‑300 (MQ=255) cTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGc < 1:700976/300‑1 (MQ=255) | GCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGC > NC_000913/3499341‑3499933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |