| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 987,174 | 0 | A | . | 99.4% | 887.8 / ‑1.9 | 170 | intergenic (‑192/+411) | ompF/asnS | outer membrane porin F/asparagine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base . (118/51); total (119/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GATCTACTTTGTTGCCATCTTTGTTATAGATTTCTGCAGCGTTTGCAGTACCTGCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTCATGGTTTTTTTTATGACACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGAGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAAACTAACGTTTCGCTACCGTGAAAGTGCTACAAAGATAAAGATTTGGTTTCAAAAAGAAAAAATATGTAACCAAAAGTAAAATTTAAGGAACTTTGTGAACACCGTCATATTTCCATAGAGACGTGATGATATTTACAGCAATTTTAATCTATTTATATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACA > NC_000913/986880‑987473 | gATCTACTTTGTTGCCATCTTTGTTATAGATTTCTGCAGCGTTTGCAGTACCTGCTACTAACAGAGCAGGGACGATCACTGCCAGAATATTGCGCTTCATCATTATTTATTACCCTCATGGTTTTTTTTATGCCACCTGCCACTGCCGTCAATAAGTTCTGTCAATAAAAATTTACGGAACTATTGATGAGGGTTTGGTGTCTTTATGTGTCTGCAGGCATCTTTCCATTCAACCTAACGTTTCGCTACCGTGAAAGTGCTAAAAAGATAAAGATTTGGTTTCAAAAAGAAAAA‑TATGTa > 2:261669/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |