Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,415,033 | C→T | R253R (CGC→CGT) | aidB → | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,415,033 | 0 | C | T | 99.5% | 622.7 / NA | 183 | R253R (CGC→CGT) | aidB | putative acyl‑CoA dehydrogenase AidB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (85/97); total (85/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAGCTT > NC_000913/4414737‑4415318 | ggACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGc < 2:926573/300‑1 (MQ=255) cgccgcTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGCGGCTGa > 1:918801/1‑300 (MQ=255) ccgcTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGCGGCTGaaa > 1:401413/1‑300 (MQ=255) gcTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGa > 1:226416/1‑300 (MQ=255) 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gcgttttttGCCTGGTGGACAACGCAACGTGGTTCGTCTCGAGCGGCGGAAAGATAAGCTGGTGAATTGCTCTAATGCAAGTTGCGAGGTGGGGTTTTAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGACTGGAAGGGGAAGGAGTTCGTTTGATCCTGAAAATGGTTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGTTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCtt < 2:463155/296‑1 (MQ=255) cTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTAGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCAATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCACCTTATGCGTCATGTCTTAAg > 1:281836/1‑300 (MQ=255) tttttGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGt < 1:443987/300‑1 (MQ=255) gACGGGCAACGCAACGCGATTCGTCTAGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGCTCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTACGTCGCATGGCa > 2:472734/1‑300 (MQ=255) gggCAACGCAACGCGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACtt > 1:951273/1‑300 (MQ=255) caacgcaatgCTATTCGTCGCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGANGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTANCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAg < 2:660427/300‑1 (MQ=255) caacgcaacgCGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAg < 1:206989/300‑1 (MQ=255) aacgcaacgcGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGANGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAGc < 1:669217/300‑1 (MQ=255) acgcaacgcGATTCGTCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCATTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAGCt > 2:500725/1‑300 (MQ=255) | GACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTTGTGCCGCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCCTGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCGTCATGTCTTAAGTCGCATGGCACTTCAGCTT > NC_000913/4414737‑4415318 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |