| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,220,830 | G→A | A553V (GCC→GTC) | arpA ← | regulator of acetyl CoA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,220,830 | 0 | G | A | 99.6% | 940.9 / NA | 259 | A553V (GCC→GTC) | arpA | regulator of acetyl CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (121/137); total (121/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GGCGTGCATGGTCAGATAAAGCAAGATAAACCGTCTCTACAACATTTTGTTGTTTATGCTGTATCGCTGAAAACAAACCGGGATATTCATTAGAATTATTTGCCAGGAGGAGGGGCTTCATATTTTTTTTATCGAATTTAAACGTATTAAACAGAGTGGGTAATGCGTTAAAAATAGTATTAATAACGTTCATGTGTCCGCGCTGCATGGCCATAAACAAACCCGTGTCGCGCGCAAGACTTTTAGCGGTCAGAAGATCTACAATATCGGAAGCTGAAATGTTAATTTCCTGGGCTAGGCTGGGCAATGCTTCAAGAATAACTTTCACGATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTGCCTTCAGGAGATCGAGTACCTGTTCTTTAGTCAAATGACATGTGCGAATTAACAAAGGTAACGCGTTCAAAACAATTTTCAGCATGTCGGCATCACCATTCGCCATAACATGGTATAAAACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAATGATGTGTTGCGGCCAG > NC_000913/4220537‑4221122 | ggCGTGCATGGTCAGATAAAGCAAGATAAACCGTCTCTACAACATTTTGTTGTTTATGCTGTATCGCTGAAAACAAACCGGGATATTCATTAGAATTATTTGCCAGGAGGAGGGGCTTCATATTTTTTTTATCGAATTTAAACGTATTAAACAGAGTGGGTAATGCGTTAAAAATAGTATTAATAACGTTCATGTGTCCGCGCTGCATGGCCATAAACAAACCCGTGTCGCGCGCAAGACTTTTAGCGGTCAGAAGATCTACAATATCGGAAGCTGAAATGTTAATTTCCTGGACTAGGc > 1:47139/1‑300 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ttCCTGGACTAGGCTGGGCAATGCTTCAAGAATAACTTTCACGATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTGCCTTCAGGAGATCGAGTACCTGTTCTTTAGTCAAATGACATGTGCGCATTAACAAAGGTAACGCGTTCAAAACAATTTTCAGCATGTCGGCATCAACATTCGCCATAACATGGTATAAAACATGGCTGGAAGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTCTACACTTGTTCGTTATCTAAATGATGTGTTGCGGCCAg > 1:433865/1‑300 (MQ=255) ttCCTGGACTAGGCTGGGCAATGCTTCAAGAATAACTTTCACGATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTGCCTTCAGGAGATCGAGTACCTGTTCTTTAGTCAAATGACATGTGCGAATTAACAAAGGTAACGCGTTCAAAACAATTTTCAGCATGTCGGCATCACCATTCGCCATAACATGGTATAAAACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAATGATGTGTTGCGGcaag > 1:522229/1‑297 (MQ=255) ttCCTGGACTAGGCTGGGCAATGCTTCAAGAATAACTTTCACGATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTGCCTTCAGGAGATCGAGTACCTGTTCTTTAGTCAAATGACATGTGCGAATTAACAAAGGTAACGCGTTCAAAACAATTTTCAGCATGTCGGCATCACCATTCGCCATAACATGGTATAAAACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGCTATCTAAATGATGTGTTGTGGCCAg > 2:325539/1‑300 (MQ=255) | GGCGTGCATGGTCAGATAAAGCAAGATAAACCGTCTCTACAACATTTTGTTGTTTATGCTGTATCGCTGAAAACAAACCGGGATATTCATTAGAATTATTTGCCAGGAGGAGGGGCTTCATATTTTTTTTATCGAATTTAAACGTATTAAACAGAGTGGGTAATGCGTTAAAAATAGTATTAATAACGTTCATGTGTCCGCGCTGCATGGCCATAAACAAACCCGTGTCGCGCGCAAGACTTTTAGCGGTCAGAAGATCTACAATATCGGAAGCTGAAATGTTAATTTCCTGGGCTAGGCTGGGCAATGCTTCAAGAATAACTTTCACGATATCGCTATGTCCATTTTGCATCGCCAGATATAGTCCTGGGCAACCATAAAAATCCTTTGCCTTCAGGAGATCGAGTACCTGTTCTTTAGTCAAATGACATGTGCGAATTAACAAAGGTAACGCGTTCAAAACAATTTTCAGCATGTCGGCATCACCATTCGCCATAACATGGTATAAAACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAATGATGTGTTGCGGCCAG > NC_000913/4220537‑4221122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |