| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,996,049 | T→A | L156* (TTG→TAG) | yigA → | DUF484 domain‑containing protein YigA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,996,049 | 0 | T | A | 98.9% | 304.9 / NA | 90 | L156* (TTG→TAG) | yigA | DUF484 domain‑containing protein YigA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (44/45); minor base C (1/0); total (45/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATGGCCCGCGCACGTAATCATATTCATGTTCTGGAAGAGAACATGGCGCTGTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTTGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGCCGCTTAACGGACCAGAGCTGCTGGTGGTGCTACCGGAAGCGAAAGCGGTGGGATCGGTGGCGATGTCGATGCTGGGAAGCGATGCTGATTTGGGTGTCGTGCTGTTTACCAGTCGCGATGCCAGTCACTATCAACAAGGGCAAGGAACGCAGTTACTTCATGAAATTGCGCTGATGTTGCCGGAGCTTCTGGAGCGTTGGATTGAACGCGTATGACCGATTTACACACCGATGTAGAACGCTACCTACGTTATCTGAGCGTGGAGCGCC > NC_000913/3995753‑3996344 | caTGGCCCGCGCACGGAATCATATTCATGTTCTGGAAGAGAACATGGCGCTGTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAggg < 1:732046/300‑1 (MQ=255) 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tatTCATGTTCTGGAAGAGAACATGGCGCTGTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTgg > 1:398626/1‑300 (MQ=255) ttCATGTTCTGGAAGAGAACATGGCGCTGTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGc < 2:570916/300‑1 (MQ=255) ttCATGTTCTGGAAGAGAACATGGCGCTGTTGATGGAACAGGCTATCGCCAACGAAGGCCTGTTTTATCGCCTACTCTACCTGCAGCGCAGTCTCACCGCCGCCAGCAGTCTCGACGATATGCTGATGCGCTTTCACCGCTGGGCGCGCGATCTCGGCCTGGCAGGTGCGAGTCTGCGCCTGTTTCCGGATCGCTGGCGCTTAGGTGCGCCGTCGAACCACACTCATCTGGCATTAAGCCGTCAGTCTTTCGAACCGCTGCGTATTCAGCGTTAGGGGCAGGAACAGCACTATCTTGGGc < 1:949993/300‑1 (MQ=255) 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