| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,555,192 | G→A | intergenic (‑10/+36) | eutR ← / ← eutK | putative DNA‑binding transcriptional regulator EutR/putative structural protein, ethanolamine utilization microcompartment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,555,192 | 0 | G | A | 98.9% | 304.8 / ‑3.8 | 89 | intergenic (‑10/+36) | eutR/eutK | putative DNA‑binding transcriptional regulator EutR/putative structural protein, ethanolamine utilization microcompartment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (29/59); total (30/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
AACGAGTTCGGCCAGACCAGGCACGACTGACGCAGCGCCAGACCGGTGTATTCACGAAAAACCTGAATATCATCGAGTAGAATTTCCGTAAATTCACCATGAAACTTGCCCGGATGCAGCTGATCGTAAATCTGCTGCCAGGCGGTAATCGTTAAAGCATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATAAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTCATGATGTTAATGCCGGGTGTTGTAGGACACCCGGCACCTCCGACAGGTTAATGGGGCTTGAGACGATAACGACTACTGCGTTTACGTAACGTCCCGGCAGAAAAGAGCTGTTCGAGCGCATTTCTGGCTTTTTCCAGCGGCCAGCCAAAGTGGGCAGCCACTTCTCCTGCCGTCATTCCCTGACGTACTGATGTTAACAGCGCCAACAACTCGTCAGCAGATTCCGCGACGATAACTGGCGCGTCGGGTTCCCTTACGGGTTGCTTCGGCTGGCGGTTAAAGCCAGTAACCAGCCACTGGGTGTCAT > NC_000913/2554896‑2555487 | aaCGAGTTCGGCCAGACCAGGCACGACTGACGCAGCGCCAGACCGGTGTATTCACGAAAAACCTGAATATCATCGAGTAGAATTTCCGTAAATTCACCATGAAACTTGCCCGGATGCAGCTGATCGTAAATCTGCTGCCAGGCGGTAATCGTTAAAGCATGTTCATAGACATCCGTTGTCTGTCGTTGATGAACATTATCCACTTCGACCTTCGGCGTGAGCTTCAGGTTTTCGGGTAAGGGTTCATGATGAAGATGGTGCAAATTGGCTGTACGGGTCTTTTTAATGATGTTAATACCg > 2:368047/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |